[发明专利]一种先导化合物的合成及筛选方法与试剂盒有效
| 申请号: | 201210555088.4 | 申请日: | 2012-12-20 |
| 公开(公告)号: | CN103882531A | 公开(公告)日: | 2014-06-25 |
| 发明(设计)人: | 李进;窦登峰;陈仰;王星;江洋;陈湜;瞿庆喜;万金桥;钟丽娜;葛啸虎;黄奇 | 申请(专利权)人: | 成都先导药物开发有限公司 |
| 主分类号: | C40B40/04 | 分类号: | C40B40/04;C40B50/04;C40B20/04;C40B70/00 |
| 代理公司: | 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 | 代理人: | 李高峡;张娟 |
| 地址: | 610041 四川省成都市高新区*** | 国省代码: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 先导 化合物 合成 筛选 方法 试剂盒 | ||
技术领域
本发明涉及化学领域,特别是涉及一种先导化合物的合成及筛选方法与试剂盒。
背景技术
自80年代末期,随着分子生物学研究的突破—高通量筛选技术的发展,新药开发所需要的新分子实体的数目越来越多,科学家们把注意力从寻找天然产物转入合成大数目的化合物群——化学库,化学库是由诸多不同属性的有机化合物组成的。组合化学合成法是一种合成化学库的技术,运用这项技术,不同系列的合成砌块——反应成分有序地排列起来以组成大系列的多样化分子实体群。组合化学合成法经常被人们称为数字游戏,也就是如何排列众多的合成砌块的问题。从理论上讲,组合合成的总反应产物数N是由两个因素决定的,每一步的合成砌块数目b和合成的步骤x,例如,对于一个三步的线性组合反应,如果每步的反应物数目分别是b1、b2、b3,那么理论上的总反应产物的数目是N=b1b2b3。组合化学研究的目标就是怎样有效地得到这一反应的所有产物N。近年来,从固相合成到快速液相平行合成,组合化学在合成方法上取得了突破性的进展,常用的几种合成方法有固相有机合成和液相有机合成,固相有机合成包括混合裂分法和平行合成法,液相有机合成包括多组分液相合成法和官能团转化法。
组合化学合成技术建立的化学库中,产物成千上万,甚至上亿,像经典有机合成那样一个一个的纯化分离鉴定已不再可能。高通量筛选(High throughput screening,HTS)技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机对实验数据进行分析处理,同一时间对数以千、万计的样品检测,并以相应的数据库支持整个体系运转的技术体系。高通量筛选方法极大地提高了小分子化合物筛选的速度和效率,可以从组合化学文库中筛选作用于靶标分子的化合物。但是,用传统的高通量筛选方法将化合物从化学文库中筛选出来后,纯化并确定目标化合物的结构非常困难,需要的时间长,成本高,随着化合物文库的扩大,难度更大。
为了解决该问题,申请号:95193518.6,发明名称:“用标记编码的复杂组合化学文库”的专利申请公开了一种方法,即在合成的每个阶段,在化合物进行合成的载体(例如颗粒)上,专一地进行标记,以定义随同该载体上化合物合成时伴随的特定事项(通常指所加化学试剂)。所述标记使用鉴定剂分子来完成,该分子记录合成期间载体颗粒所经历的按顺序的事项,由此提供在该载体上生产化合物的反应历程。但是该申请并未提供实现该方法的技术方案。
现有技术中有报道使用寡核苷酸标记化合物的合成单元,根据生物领域的常识,在常规条件下,双链DNA较单链DNA稳定,因此通常选择双链的寡核苷酸对化合物的合成单元进行标记,如:
公告号:EP0643778,发明名称:“encoded combinatorial chemical libraries”的专利公开了用单链寡核苷酸标记氨基酸或多肽的方法;公告号:US7935658,发明名称:“methods for synthsis of encoded libraries”的专利公开了一种用双链DNA片段标记合成砌块,形成化合物文库的方法;申请号:WO/2010/094036,发明名称:“METHODS OF CREATING AND SCREENING DNA-ENCODED LIBRARIES”的专利申请公开了用寡核苷酸标记化合物,形成化合物文库的方法,其寡核苷酸为发卡结构的双链DNA。
但是,用双链DNA标记合成砌块或者化合物时,在连接延伸过程中,双链DNA容易交联,形成卷曲的三级结构,测序时,需要解链,操作较复杂,用双链DNA标记三步以上的线性组合反应时,双链DNA的测序结果误差较大,导致该方法只能停留在两维,因而只能通过增加每一步反应的合成砌块数目来增加文库中化合物数量,制得的化合物文库多样性差,不易合成得到目标化合物。
需要寻找新的,操作简便,结果更准确的标记方法。
发明内容
为了解决上述问题,本发明提供了一种先导化合物的合成及筛选的试剂盒和方法,以及一种新的组合化学文库。
名词解释:
合成砌块(Synthetic Building Block),又叫合成子,是指具备各种理化性质以及特定生物化学性质的、在新药(西药、农药)研发过程中必须使用的小分子化合物。
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