[发明专利]XRCC2基因突变检测特异性引物和液相芯片

说明书

技术领域

本发明属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种XRCC2基因突变检测特异性引物和液相芯片。

背景技术

中国仓鼠细胞X射线修复补缺陷修复2（X-ray repair complementing defective repair inChinese hamster cells 2，XRCC2），位于7号染色体7q36.1上。XRCC2基因是RecA/Rad51相关蛋白家族的成员，参与同源重组以维持染色体的稳定性和修复DNA损伤。XRCC2基因是参与DNA双链断裂修复的重要基因，在同源重组修复(homologyrecombination，HR)和非同源末端连接(non-homology endjoining，NHEJ)中发挥重要作用，其单核苷酸多态性所导致修复能力的个体差异可能是决定肿瘤发病风险差异的重要因素。XRCC2基因多态性与结直肠癌、膀胱癌、乳腺癌、基底细胞癌等肿瘤易感性有关。

目前，XRCC2基因突变检测方法主要有：荧光定量PCR技术、SNPlexTM System技术和基质辅助激光解析电离时间飞行质谱技术（MALDI-TOF-MS），荧光定量PCR技术灵敏度高、特异性强、自动化程度高的特点，但存在样品易污染、假阳性率高的缺点，且每次只能检测一种突变类型，不能满足实际应用的需要。SNPlexTM System技术对SNP序列特异性要求较高，不能随意地分析所选择的单核苷酸多态性位点，难以应用于临床检测诊断，而且该方法操作比较复杂，同样不能满足实际应用的需要。基质辅助激光解析电离时间飞行质谱技术是一种软电离技术，在蛋白质等生物大分子的检测中有着强大而成熟的功能，但是在核酸检测领域，由于核酸分子本身的特殊性，检测受到一定的限制。

本发明目标检测的XRCC2基因突变位点，如表所示：

序号XRCC2基因位点突变的内容简写1SEQ ID NO.41的第87位核苷酸，发生G→A突变G87A2SEQ ID NO.42的第158位核苷酸，发生G→C突变G158C3SEQ ID NO.43的第82位核苷酸，发生A→G突变A82G6SEQ ID NO.44的第155位核苷酸，发生A→C突变A155C

SEQ ID NO.41突变位点：G87A

CGTCAATGGAGGAGAAAGTGTGAACTTACAGGAGTCTACTCTGAGGAAATGTTCTCAGTGCTTAGAGAAGCTTGTAAATGACTATCCCTGGTTCTTTTTGCAACGACACAAACTATAATGCAGAAAGCCTCGAGCTCATCAGAAGAACCTTCTCATGCCTCTCGACGACTGTGTGATGTGGACATAGACTACAGACCTTATCTCTGTAAGGCATGGCAGCAACTGGTGAAGCACAGGA

SEQ ID NO.42突变位点：G158C