[发明专利]RAD51L1基因突变检测特异性引物和液相芯片有效

专利信息
申请号: 201210512190.6 申请日: 2012-12-04
公开(公告)号: CN103849939A 公开(公告)日: 2014-06-11
发明(设计)人: 陈昌华;许昌有 申请(专利权)人: 益善生物技术股份有限公司
主分类号: C40B40/06 分类号: C40B40/06;C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 代理人: 万志香;秦雪梅
地址: 510663 广东省广州市广州科*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: rad51l1 基因突变 检测 特异性 引物 芯片
【说明书】:

技术领域

发明属于分子生物学领域,涉及医学和生物技术,具体的是涉及一种RAD51L1基因突变检测特异性引物和液相芯片。

背景技术

RAD51样1(RAD51-like1,RAD51L1)也称为hREC2或者RAD51B,位于14号染色体14q23-24的长臂上,具体位于14号染色体68286495到69062737碱基对之间,RAD51L1基因是编码修复双链DNA断裂的一种酶,但是这种基因的过度表达将导致细胞周期G1延迟和细胞凋亡,这表明这种蛋白质在DNA损伤时发挥一定的作用。RAD51L1编码的蛋白质是Rad51蛋白家族的成员。RAD51家族成员对于同源重组DNA修复是不可缺少的保守蛋白,在DNA复制过程中,参与双链DNA断裂的同源重组修复途径。另外,RAD51L1基因发生的染色体变异与肺软骨样错构瘤和子宫平滑肌瘤的发生有相关性,而且RAD51L1基因多态性会增加乳腺癌发生的风险。

目前,RAD51L1基因突变检测方法主要有:Illumina光纤微珠芯片技术、微阵列技术和荧光定量PCR技术,虽然Illumina光纤微珠芯片技术是高灵敏度和精确性的高通量检测系统,但是自动化程度低,手工操作比较多,难以满足实际应用的需要,微阵列技术存在成本昂贵、复杂、检测灵敏度较低、重复性差、分析范围较狭窄,探针的合成与固定比较复杂等问题,另外,由于杂交位于固相表面,有一定程度的空间阻碍作用。荧光定量PCR技术灵敏度高、特异性强、自动化程度高的特点,但存在样品易污染、假阳性率高的缺点,且每次只能检测一种突变类型,同样不能满足实际应用的需要。

本发明目标检测的RAD51L1基因突变位点,如表所示:

序号RAD51L1基因位点突变的内容简写1SEQ ID NO.41的第167位核苷酸,发生C→T突变C167T2SEQ ID NO.42的第76位核苷酸,发生A→T突变A76T3SEQ ID NO.43的第187位核苷酸,发生T→G突变T187G4SEQ ID NO.44的第99位核苷酸,发生T→G突变T99G

SEQ ID NO.41突变位点:C167T

GCCATTATTGTCTCCTCCTTTCATATTAGCCCCATCTCTGTAAGTAGATTTTAAGCTCCTGGTACTTGGATTCTACCATAGTGCCTGGCCTGTGGCAGGAGTTCCATATGCAGGGCTGACATATTGCATAGTTCCAGGGGTCCCGTTCACATGATATGAATGGGGCCCTGGAGTTACACAAGTTATAGCCCTGTCCATAAGTCCTTGGTGATTGAATAAAACTCATTCCAGGACCTGAAAAAGAAACAATTATTGTGATCATGGTTCAGTTCAAATCTTCAGGTGATTATTGAACAGCTACTATGTACTAACCACCAATGATACAAAAAATGAATAAAATGGCTGTTCCTACCCTCTG

SEQ ID NO.42突变位点:A76T

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