[发明专利]同步检测TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的方法无效
申请号: | 201210492173.0 | 申请日: | 2012-11-28 |
公开(公告)号: | CN102952901A | 公开(公告)日: | 2013-03-06 |
发明(设计)人: | 李凡;刘芳;陈海如;谭冠林;兰平秀;王海宁;李晓静;朱静;吴德喜;蔡红 | 申请(专利权)人: | 云南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/94 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 650201 云南*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 同步 检测 tbtv tvdv sat tvdvarna 方法 | ||
1.同步检测TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的方法,其特征在于,同步检测按照下面步骤进行:
(1)引物设计合成:
(a)分别设计合成检测TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的正向引物TBTVdF、TVDVdF、SatTBTVdF和TVDVaRNAdF,引物序列如下:
TBTVdF:5’-TACCACACCTAAACAGCGTTG-3’,
TVDVdF:5’-GCAACAGCGAGACTTTCATCT-3’,
SatTBTVdF:5’-TGTTGGCCGTGGGCAGCAA-3’,
TVDVaRNAdF:5’-GCGTACTGCGGAAGTCTCAC-3’,
(b)分别设计合成检测TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的反向引物TBTVdR、TVDVdR、SatTBTVdR和TVDVaRNAdR,引物序列如下:
TBTVdR:5’-CTCATCTCCCGCTAAGTCAG-3’,
TVDVdR:5’-CRTTGCCTTTATAGAGCAGCC-3’,其中,序列中的R=A或G,
SatTBTVdR:5’-TTCGTATTTGGCTCCGTCGC-3’,
TVDVaRNAdR:5’-TGTACTGGAGTGCTTCAACCG-3’;
(2)CTAB法提取染病植物组织或传毒介体昆虫的总核酸,作为RT-PCR扩增模板;
(3)一步法RT-PCR扩增;
(4)电泳检测;
(5)检测结果分析:根据每对引物扩增片段大小与病毒的关系,观察感染TBTV、TVDVaRNA、Sat-TBTV和TVDV的烟草材料或传毒介体昆虫中检测到的不同核酸带,判断发病烟草或传毒介体昆虫中具体感染的TBTV、TVDVaRNA、Sat-TBTV和TVDV 病原物的种类。
2.根据权利要求1所述的同步检测TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的方法,其特征在于,所述CTAB法提取感病植物组织或传毒介体昆虫的总核酸,步骤如下:
第一步、样品准备
(1)感病植物组织准备:将3~5片病叶叠加在一起,称取50~100 mg至研钵中;
(2)传毒介体昆虫准备:取30~50头蚜虫至研钵中;
第二步、加入1.2 mL的CTAB缓冲液,该缓冲液由质量百分比为2%的CTAB、2%的PVP-40以及pH 8.0的100 mM的Tris-HCl、1.4 M的 NaCl和20 mM 的EDTA组成混合液,最后根据混合溶液的体积加入0.2%巯基乙醇;
第三步、恒温处理:充分研磨后,转入1.5 mL的离心管中,在65℃温浴下处理15~60 min;
第四步、离心处理:首先,将离心管放入离心机中12000~13000 r/min离心处理15 min,取750 μL上清液至另一1.5 mL的离心管,加入750 μL体积比为24∶1的氯仿:异戊醇,涡旋震荡混匀30 s;然后,再将装有上清液的离心管放入离心机中12000~13000 r/min离心处理10 min,接着,用微量移液器吸取600 μL上清液至又一1.5 mL的离心管中,并加入600 μL异丙醇,颠倒离心管充分混匀液体,室温下放置10 min,最后将装有上清液和异丙醇的离心管放入离心机中12000~13000 r/min离心处理15 min,用微量移液器吸出上清液;沉淀部分加入500 μL 70% 的乙醇,并放入离心机中12000~13000 r/min离心处理10 min;
第五步、干燥:用微量移液器吸出液体,沉淀部分在20℃~25℃条件下自然干燥10~15 min;
第六步、溶解:加入100 μL 20 mmol/L pH 8.0的Tris-HCl并置于冰上10 min,用微量移液器吹打5~10次使沉淀部分充分溶解;
第七步、保存:核酸沉淀溶解液-20℃保存备用;或者将所获得的总核酸以干粉状态放入-80℃进行长期保存备用。
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