[发明专利]同步检测TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的方法无效

专利信息
申请号: 201210492173.0 申请日: 2012-11-28
公开(公告)号: CN102952901A 公开(公告)日: 2013-03-06
发明(设计)人: 李凡;刘芳;陈海如;谭冠林;兰平秀;王海宁;李晓静;朱静;吴德喜;蔡红 申请(专利权)人: 云南农业大学
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/94
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 650201 云南*** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 同步 检测 tbtv tvdv sat tvdvarna 方法
【权利要求书】:

1.同步检测TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的方法,其特征在于,同步检测按照下面步骤进行:

(1)引物设计合成:

(a)分别设计合成检测TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的正向引物TBTVdF、TVDVdF、SatTBTVdF和TVDVaRNAdF,引物序列如下:

TBTVdF:5’-TACCACACCTAAACAGCGTTG-3’,

TVDVdF:5’-GCAACAGCGAGACTTTCATCT-3’,

SatTBTVdF:5’-TGTTGGCCGTGGGCAGCAA-3’,

TVDVaRNAdF:5’-GCGTACTGCGGAAGTCTCAC-3’,

    (b)分别设计合成检测TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的反向引物TBTVdR、TVDVdR、SatTBTVdR和TVDVaRNAdR,引物序列如下:

     TBTVdR:5’-CTCATCTCCCGCTAAGTCAG-3’,

     TVDVdR:5’-CRTTGCCTTTATAGAGCAGCC-3’,其中,序列中的R=A或G,

     SatTBTVdR:5’-TTCGTATTTGGCTCCGTCGC-3’,

TVDVaRNAdR:5’-TGTACTGGAGTGCTTCAACCG-3’;

 (2)CTAB法提取染病植物组织或传毒介体昆虫的总核酸,作为RT-PCR扩增模板;

 (3)一步法RT-PCR扩增;

(4)电泳检测;

(5)检测结果分析:根据每对引物扩增片段大小与病毒的关系,观察感染TBTV、TVDVaRNA、Sat-TBTV和TVDV的烟草材料或传毒介体昆虫中检测到的不同核酸带,判断发病烟草或传毒介体昆虫中具体感染的TBTV、TVDVaRNA、Sat-TBTV和TVDV 病原物的种类。

2.根据权利要求1所述的同步检测TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的方法,其特征在于,所述CTAB法提取感病植物组织或传毒介体昆虫的总核酸,步骤如下:

第一步、样品准备

(1)感病植物组织准备:将3~5片病叶叠加在一起,称取50~100 mg至研钵中;

(2)传毒介体昆虫准备:取30~50头蚜虫至研钵中;

第二步、加入1.2 mL的CTAB缓冲液,该缓冲液由质量百分比为2%的CTAB、2%的PVP-40以及pH 8.0的100 mM的Tris-HCl、1.4 M的 NaCl和20 mM 的EDTA组成混合液,最后根据混合溶液的体积加入0.2%巯基乙醇;

第三步、恒温处理:充分研磨后,转入1.5 mL的离心管中,在65℃温浴下处理15~60 min;

第四步、离心处理:首先,将离心管放入离心机中12000~13000 r/min离心处理15 min,取750 μL上清液至另一1.5 mL的离心管,加入750 μL体积比为24∶1的氯仿:异戊醇,涡旋震荡混匀30 s;然后,再将装有上清液的离心管放入离心机中12000~13000 r/min离心处理10 min,接着,用微量移液器吸取600 μL上清液至又一1.5 mL的离心管中,并加入600 μL异丙醇,颠倒离心管充分混匀液体,室温下放置10 min,最后将装有上清液和异丙醇的离心管放入离心机中12000~13000 r/min离心处理15 min,用微量移液器吸出上清液;沉淀部分加入500 μL 70% 的乙醇,并放入离心机中12000~13000 r/min离心处理10 min; 

第五步、干燥:用微量移液器吸出液体,沉淀部分在20℃~25℃条件下自然干燥10~15 min;

第六步、溶解:加入100 μL 20 mmol/L pH 8.0的Tris-HCl并置于冰上10 min,用微量移液器吹打5~10次使沉淀部分充分溶解;

第七步、保存:核酸沉淀溶解液-20℃保存备用;或者将所获得的总核酸以干粉状态放入-80℃进行长期保存备用。

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