[发明专利]基于多核CPU和GPGPU硬件的高通量测序数据质量控制系统有效

专利信息
申请号: 201210478392.3 申请日: 2012-11-22
公开(公告)号: CN103838985A 公开(公告)日: 2014-06-04
发明(设计)人: 周茜;宁康;苏晓泉;徐健 申请(专利权)人: 中国科学院青岛生物能源与过程研究所
主分类号: G06F19/20 分类号: G06F19/20
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 266101 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 基于 多核 cpu gpgpu 硬件 通量 序数 质量 控制系统
【权利要求书】:

1.一种软硬件结合的计算机高通量测序数据质量控制系统,其特征是:系统包含计算机硬件和基于其上的软件系统,输入是在任何存储介质上保留的高通量测序数据文件,输出去除低质量序列和污染序列的定性及定量信息。

2.根据权利要求1所述的计算机高通量测序数据质量控制系统,其特征是:计算机硬件系统包括GPGPU硬件、多核CPU硬件、存储介质等,是一个完整的计算机硬件系统。

3.根据权利要求1所述的高通量测序数据质量控制系统,其特征是:计算机软件系统包括与多核CPU以及GPGPU硬件系统兼容的完整的高通量测序数据质量控制分析软件,是一个完整的计算机软件分析系统;该软件系统的运行界面为命令行形式,输出结果为网页形式的文档、图片以及文本形式,配电子版使用说明。

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