[发明专利]四物汤治疗痛经作用靶点的筛选方法

说明书

技术领域

本发明属于生物信息技术领域，具体涉及利用基因芯片技术和中药数据库来筛选四物汤治疗痛经作用靶点的方法。

背景技术

四物汤首见于宋代《太平惠民和剂局方》，由熟地、当归、白芍、川芎配伍而成。四物汤在临床广泛应用，历来被视为补血调经之基本方，用以治月经不调，痛经等症，症见眩晕、耳聋、惊惕、唇爪无华。方中当归补血养肝，和血调经；熟地滋养阴血；佐以白芍和营养肝，使以川芎，活血行滞。四药合用，则补中有通，补而不滞。

但是，四物汤作为调经良方，其作用靶点和作用机制尚不清楚。因此，寻找一种科学、精确的方法用以筛选四物汤治疗痛经的作用靶点，从而探寻其分子层面的作用机制十分必要。

发明内容

针对现有技术存在的上述问题，本申请人经过研究，提供一种快速、精确的四物汤治疗痛经作用靶点的筛选方法。通过本发明方可成功筛选出四物汤治疗痛经的作用靶点（靶向蛋白），有助于从分子层面解释其治疗痛经的作用机理。

本发明的技术方案如下：

 一种四物汤治疗痛经作用靶点的筛选方法，包括如下步骤：

   （1）挑选差异表达基因：

从基因表达谱数据库GEO中下载编号为GSE23610的基因芯片数据，得到经高浓度四物汤处理的乳腺癌细胞MCF-7和的经二甲基亚砜处理的乳腺癌细胞MCF-7的表达谱数据，以前者作为试验组，后者作为对照组，挑选出二者差异表达基因；

   （2）作用靶点预测分析：

   利用中药数据库TCMID搜集得到四物汤作用靶点，并将其与步骤（1）所得差异表达基因进行交集，得到四物汤预测作用靶点；

   （3）通路富集分析：

   对步骤（2）所得预测作用靶点进行通路富集分析； 

  （4）选择步骤（3）所得富集通路中与四物汤治疗痛经作用相关的通路，并筛选出所述通路下富集的靶点，即得四物汤抗辐射作用靶点。   

    其进一步的技术方案为：

步骤（1）中，设定P值（P-value）小于0.05，倍数变化值(Fold change大于1.5。

步骤（3）所述通路富集分析工具为网络分析软件Cytoscape的插件ClueGO，设定P 值（P-value）小于0.05。

本发明有益的技术效果在于：

本发明将基因芯片技术和中药靶点数据库创造性地结合起来，提供了一种快速、精确的四物汤治疗痛经作用靶点的筛选方法；运用本发明方法成功地筛选出两个四物汤治疗痛经作用的靶点（靶向蛋白），即原癌基因蛋白fos，转录因子AP-1，有助于从分子层面解释其治疗痛经的作用机理，为治疗痛经的天然药物的开发以及其他中药确切作用靶点的筛选提供了新思路。

具体实施方式

下面结合实施例，说明本发明具体的实施方式。

一种四物汤治疗痛经作用靶点的筛选方法，具体包括如下步骤：

    1. 挑选差异表达基因

从基因表达谱数据库GEO中下载编号为GSE23610的基因芯片数据；得到经高浓度四物汤（质量浓度为2.56mg/ml）处理的乳腺癌细胞MCF-7和的经二甲基亚砜（质量分数为0.001%）处理的乳腺癌细胞MCF-7的表达谱数据，以前者作为试验组，后者作为对照组，挑选出二者差异表达基因；在该步骤中，设定P值小于0.05，倍数变化值大于1.5，共计得到2405个差异表达基因。

2. 四物汤作用靶点预测分析

从中药数据库TCMID (http://www.megabionet.org/tcmid/) 中，搜集得到102个四物汤的靶点数据；由于mRNA水平的上下调与其编码蛋白质的增加与减少并不完全正相关，因此我们利用搜集到的上述靶点的标识（symbol）与步骤1所得2405个差异表达基因进行交集，共计得到20个四物汤预测作用靶点。

3. 通路富集分析 

在步骤3所得20个四物汤预测作用靶点的基础上，利用网络分析软件Cytoscape 2.6的插件ClueGO 做通路富集分析；在该步骤中，设定P值小于0.05，共计得到40条通路。

4. 选择步骤3所得富集通路中与四物汤治疗痛经作用相关的通路，并筛选出所述通路下富集的靶点，即得四物汤抗辐射作用靶点。