[发明专利]四物汤抗辐射作用靶点的筛选方法无效
申请号: | 201210454959.3 | 申请日: | 2012-11-14 |
公开(公告)号: | CN103150488A | 公开(公告)日: | 2013-06-12 |
发明(设计)人: | 石铁流;方钊 | 申请(专利权)人: | 无锡力盟生物科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/16 | 分类号: | G06F19/16 |
代理公司: | 无锡华源专利事务所(普通合伙) 32228 | 代理人: | 冯智文 |
地址: | 214000 江苏省无锡*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 四物汤抗 辐射 作用 筛选 方法 | ||
1.一种四物汤抗辐射作用靶点的筛选方法,其特征在于包括如下步骤:
(1)挑选差异表达基因:
从基因表达谱数据库GEO中下载编号为GSE23610的基因芯片数据,得到经高浓度四物汤处理的乳腺癌细胞MCF-7和的经二甲基亚砜处理的乳腺癌细胞MCF-7的表达谱数据,以前者作为试验组,后者作为对照组,挑选出二者差异表达基因;
(2)作用靶点预测分析:
利用中药数据库TCMID搜集得到四物汤作用靶点,并将其与步骤(1)所得差异表达基因进行交集,得到四物汤预测作用靶点;
(3)通路富集分析:
对步骤(2)所得预测作用靶点进行通路富集分析,得到富集通路;
(4)选择步骤(3)所得富集通路中与四物汤抗辐射作用相关的通路,并筛选出所述通路下富集的靶点,即得四物汤抗辐射作用靶点。
2.根据权利要求1所述四物汤抗辐射作用靶点的筛选方法,其特征在于:步骤(1)中,设定P值小于0.05,倍数变化值大于1.5。
3.根据权利要求1所述四物汤抗辐射作用靶点的筛选方法,其特征在于:步骤(3)所述通路富集分析工具为网络分析软件Cytoscape的插件ClueGO,设定P 值小于0.05。
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