[发明专利]玉米油份含量相关的衣被蛋白复合体(COPⅡ)基因位点及应用有效

专利信息
申请号: 201210444717.6 申请日: 2012-11-09
公开(公告)号: CN102978203A 公开(公告)日: 2013-03-20
发明(设计)人: 严建兵;杨小红;李建生;李慧 申请(专利权)人: 华中农业大学
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/68
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 430070 *** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 玉米油 含量 相关 蛋白 复合体 cop 基因 应用
【权利要求书】:

1.玉米油份含量相关的衣被蛋白复合体(COPII)基因位点分子标记,其特征在于,所述的相关分子标记具体位点位于玉米参考基因组(www.maizesequence.org,5a.60版)chr8.S_38521846的SNP,该位点突变为G/T,以及位于玉米COPII基因(GRMZM2G003022)5’UTR区域InDel_20位点,上述位点与玉米油分含量显著相关。

2.如权利要求1所述的分子标记的应用,其特征在于,该应用包括以下步骤:

a)由473个普通玉米自交系和35个高油玉米自交系组成AM508群体;

b)从授粉15天后的AM508份自交系中随机选择368份自交系,构建200bp大小插入片段文库,采用90bp末端配对的RNA测序技术进行转录组测序。

3.如权利要求1所述的玉米衣被蛋白复合体(COPII)基因分子标记的特异性扩增引物序列,其特征在于:所述COPII基因的InDel_20功能位点开发的PCR分子标记序列为:

5′-GCCGAGGTCCAGCCGTAGT-3′

5′-GGCGAGGCCTGGAGAGAA-3′。

4.如权利要求1或2所述的玉米油份含量相关的衣被蛋白复合体(COPII)基因位点分子标记的应用,其特征在于:玉米基因序列通过比对B73参考序列获得,利用Primer 5和Primer 3设计引物扩增全长,利用MUSCLE软件和BioEdit软件进行多序列处理和比对,利用TASSEL 2.0.1软件提取SNP和InDel,同时通过1000次排列 检验计算多态性间的r2值,采用F测验计算两个显著性信号位点间两两的连锁不平衡。

5.如权利要求1或2所述的与玉米油份相关的SNP位点及玉米衣被蛋白复合体(COPII)基因功能分子标记在玉米育种的应用。 

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