[发明专利]玉米油份含量相关的衣被蛋白复合体(COPⅡ)基因位点及应用有效
申请号: | 201210444717.6 | 申请日: | 2012-11-09 |
公开(公告)号: | CN102978203A | 公开(公告)日: | 2013-03-20 |
发明(设计)人: | 严建兵;杨小红;李建生;李慧 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 430070 *** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 玉米油 含量 相关 蛋白 复合体 cop 基因 应用 | ||
1.玉米油份含量相关的衣被蛋白复合体(COPII)基因位点分子标记,其特征在于,所述的相关分子标记具体位点位于玉米参考基因组(www.maizesequence.org,5a.60版)chr8.S_38521846的SNP,该位点突变为G/T,以及位于玉米COPII基因(GRMZM2G003022)5’UTR区域InDel_20位点,上述位点与玉米油分含量显著相关。
2.如权利要求1所述的分子标记的应用,其特征在于,该应用包括以下步骤:
a)由473个普通玉米自交系和35个高油玉米自交系组成AM508群体;
b)从授粉15天后的AM508份自交系中随机选择368份自交系,构建200bp大小插入片段文库,采用90bp末端配对的RNA测序技术进行转录组测序。
3.如权利要求1所述的玉米衣被蛋白复合体(COPII)基因分子标记的特异性扩增引物序列,其特征在于:所述COPII基因的InDel_20功能位点开发的PCR分子标记序列为:
5′-GCCGAGGTCCAGCCGTAGT-3′
5′-GGCGAGGCCTGGAGAGAA-3′。
4.如权利要求1或2所述的玉米油份含量相关的衣被蛋白复合体(COPII)基因位点分子标记的应用,其特征在于:玉米基因序列通过比对B73参考序列获得,利用Primer 5和Primer 3设计引物扩增全长,利用MUSCLE软件和BioEdit软件进行多序列处理和比对,利用TASSEL 2.0.1软件提取SNP和InDel,同时通过1000次排列 检验计算多态性间的r2值,采用F测验计算两个显著性信号位点间两两的连锁不平衡。
5.如权利要求1或2所述的与玉米油份相关的SNP位点及玉米衣被蛋白复合体(COPII)基因功能分子标记在玉米育种的应用。
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