[发明专利]一种玉米油份含量相关的LACS基因位点及其应用有效
申请号: | 201210444682.6 | 申请日: | 2012-11-09 |
公开(公告)号: | CN102911949A | 公开(公告)日: | 2013-02-06 |
发明(设计)人: | 严建兵;杨小红;李建生;李慧 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C12N15/52 | 分类号: | C12N15/52;C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 430070 *** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 玉米油 含量 相关 lacs 基因 及其 应用 | ||
1.一种玉米油份含量相关的LACS基因位点,其特征在于,所述的基因位点为长链酰基辅酶A合成酶基因,位于玉米参考基因组(www.maizesequence.org,5a.60版)chr2.S_149517635的SNP,该位点突变为T/G。以及位于玉米LACS基因(GRMZM2G079236)3’UTR的InDel_146/472(146bp的插入/472bp的缺失和146bp的缺失/472bp的插入)位点。
2.如权利要求1所述的玉米油份含量相关的基因位点的应用,其特征在于包括以下步骤:
a)由473个普通玉米自交系和35个高油玉米自交系组成AM508群体;
b)从授粉15天后的AM508份自交系中随机选择368份自交系,构建200bp大小插入片段文库,采用90bp末端配对的RNA测序技术进行转录组测序。
3.如权利要求1或2所述的玉米油份含量相关的基因位点的应用,其特征在于:玉米LACS基因的InDel_146/472功能位点开发的PCR分子标记序列为:
5′-CGGGTGGAACTTGTTATGGC-3′
5′-AGGGCACTGAATCGGAACAC-3。
4.如权利要求1或2所述的玉米油份含量相关的基因位点及其应用,其特征在于:玉米基因序列通过比对B73参考序列获得,利用Primer Premier5和Primer3设计引物扩增全长,利用MUSCLE软件和BioEdit软件进行多序列处理和比对,利用TASSEL 2.0.1软 件提取SNP和InDel,同时通过1000次排列检验计算多态性间的r2值,采用F测验计算两个显著性信号位点间两两的连锁不平衡。
5.如权利要求1所述的玉米油份含量相关的基因位点在玉米育种的应用。
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