[发明专利]利用单管巢式实时聚合酶链反应(PCR)的改良结核菌诊断方法有效
申请号: | 201210400806.0 | 申请日: | 2012-10-19 |
公开(公告)号: | CN103509790A | 公开(公告)日: | 2014-01-15 |
发明(设计)人: | 李惠泳 | 申请(专利权)人: | 延世大学校原州产学协力团 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 北京信慧永光知识产权代理有限责任公司 11290 | 代理人: | 张淑珍;王维玉 |
地址: | 韩国*** | 国省代码: | 韩国;KR |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 单管巢式 实时 聚合 反应 pcr 改良 结核菌 诊断 方法 | ||
1.一种引物组,其特征在于,所述引物组由序号1-4,序号6-9及序号12-15的引物构成。
2.一种结核菌检测试剂盒,其特征在于,所述结核菌检测试剂盒包括权利要求1中所述的引物组。
3.根据权利要求2所述的结核菌检测试剂盒,其特征在于,还包括探针。
4.根据权利要求3所述的结核菌检测试剂盒,其特征在于,所述探针选自由序号5、序号10-11及序号16构成的群。
5.根据权利要求3所述的结核菌检测试剂盒,其特征在于,所述探针的5'端和3'端标有荧光剂。
6.根据权利要求5所述的结核菌检测试剂盒,其特征在于,所述5'端标有的荧光剂是选于由6-羧基荧光素、六氯乙烷-6-羧基荧光素、四氯-6-羧基荧光素及花青素5构成的群,所述3'端标有的荧光剂是6-羧甲基-若丹明或BHQ(black hole quencher)-1,2,3(BHQ-1,2,3)。
7.根据权利要求2所述的结核菌检测试剂盒,其特征在于,所述结核菌选于由Mycobacterium tuberculosis、M.bovis、M.africanum、M.canetii及M.microti构成的群。
8.一种结核菌检测方法,其特征在于,包括从样品中抽取DNA,针对所述DNA进行实时定量PCR,将序号1-2、序号6-7及序号12-13的第一引物和序号3-4、序号8-9及序号14-15的第二引物与所述DNA放入同一管内,进行增幅的阶段。
9.根据权利要求8所述的结核菌检测方法,其特征在于,所述管还包括探针。
10.根据权利要求9所述的结核菌检测方法,其特征在于,所述探针选自由序号5、序号10-11及序号16构成的群。
11.根据权利要求9所述的结核菌检测方法,其特征在于,所述探针的5'端和3'端标有荧光剂。
12.根据权利要求8所述的结核菌检测方法,其特征在于,所述结核菌选于由Mycobacterium tuberculosis、M.bovis、M.africanum、M.canetii及M.microti构成的群。
13.根据权利要求8所述的结核菌检测方法,其特征在于,所述第一引物及所述第二引物的浓度为10pg。
14.根据权利要求8所述的结核菌检测方法,其特征在于,所述样品为咳痰、小便或肿瘤组织。
15.一种定量方法,其特征在于,所述遗传基因定量方法包括以下阶段:
a.在存在于单管的序号1-4、序号6-9及序号12-15的引物组成物中,混合自试料抽取出的菌的DNA,准备遗传基因分析试料的阶段;
b.在所述a阶段的遗传基因分析试料中,进行实时巢式PCR,获取PCR产物的阶段;
c.对所述b阶段的PCR产物进行定量,获取定量曲线的阶段;及
d.利用所述定量曲线,对存在自试料抽取的菌的DNA的rpoB及IS6110遗传基因特异遗传基因定量的阶段。
16.根据权利要求15所述的方法,其特征在于,所述方法还包括选自管内序号5、序号10-11及序号16构成群的探针。
17.一种改善结核菌敏感性及特异性方法,其特征在于,所述改善结核菌敏感性及特异性方法是在利用巢式实时PCR检测结核菌的方法中,将序号1-2、序号6-7及序号12-13的第一引物和序号3-4、序号8-9及序号14-15的第二引物放入同一管内,进行增幅,对选自Mycobacterium tuberculosis、M.bovis、M.africanum、M.canetii及M.microti构成群的结核菌的敏感性和特异性进行改善的方法。
18.一种试剂盒的结核菌检测用途,其特征在于,所述试剂盒的结核菌检测用途包括由序号1-4、序号6-9及序号12-15的引物构成的引物组。
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