[发明专利]来源于棉花的miRNA-GhmiRnC及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及生物技术领域，尤其涉及一种来源于棉花的miRNA-GhmiRnC及其应用。

背景技术

miRNA（microRNA，微小RNA）是一类长度约为20-24nt的内源单链非编码小分子RNA，在生物体中广泛存在（Bartel D P.MicroRNAs:genomics,biogenesis,mechanisms,and function.Cell,2004,116:281-297.）。近年来大量研究表明，miRNA能够调控生物体中许多基因的表达，在调节生长发育、细胞增殖、凋亡、抵御环境胁迫等诸多方面发挥重要作用（Bushati N,Cohen S M.MicroRNA functions.Annu.Rev.Cell Dev.Biol.,2007,23:175-205.；金龙国,王川,刘进元.植物MicroRNA.中国生物化学与分子生物学报,2006,22:609-614.）。植物miRNA主要通过切割靶基因mRNA，或抑制靶mRNA翻译，来调控植物个体生长发育并影响其生理过程，是一种新的基因调控模式，具有重要的研究意义（Voinnet O.Origin,biogenesis,and activity of plant microRNAs.Cell,2009,136:669-687.）。

棉花是世界最重要的经济作物之一，同时棉花纤维也是研究单细胞伸长的良好模型。与拟南芥、水稻等模式生物相比，目前已经发现的棉花miRNA数量可谓寥寥无几，因此通过高通量测序技术，有望挖掘出更多的棉花miRNA，这对于全面了解棉花乃至整个植物miRNA的形成过程、结构特点和功能机制具有现实意义。另外，棉花中miRNA可能在诸多生理过程（如纤维的起始与伸长等）发挥重要功能，但棉花中关于miRNA的生物学功能研究甚少，因此，通过关注特定发育时期、特定组织中的miRNA，有望阐明棉花miRNA参与的生理过程，以及在该过程中具体发挥的作用。

我国是世界上主要的棉花生产和消费国，棉花对于我国具有举足轻重的地位。国内外除了利用常规育种手段之外，逐步运用基因工程技术对棉花纤维产量、品质、抗虫等进行遗传改良已经成为了一种趋势。由于miRNA对植物有广泛的调控作用，很可能成为植物遗传改良的重点研究基因之一，因此迫切需要通过大规模测序方法充分挖掘和开发属于本国知识产权的新的miRNA基因，从而为后期定向改良和培育优质性状的棉花品种奠定基础。

发明内容

本发明的目的是提供来源于棉花的miRNA-GhmiRnC及其应用。

本发明提供了miRNA-GhmiRnC，为单链RNA,为序列表的序列1所示的RNA，序列如下（5'→3'）：UAAGUGAAGAAAGAGGUAGGUU。

本发明还提供miRNA-GhmiRnC前体（pre-GhmiRnC），为单链RNA,为序列表的序列2所示的RNA，序列如下（5'→3'）：GAAGGACAACUAAGUGAAGAAAGAGGUAGGUUUGAAGAAGAAGAUGGUAAGCUGAGUUUAAGAGGAAUGGUGAACUUAAUUGAGAUCAUCUUCUCCUAGUUUUCGUCACAUGAACCUUUCUUCAUUUAGAUCUUCAAACCAGCCUUUUCUUCACUUAGUUGUCCUUCC。

序列1所示RNA或序列2所示的RNA在抑制钙调素结合蛋白基因（TC259543）表达中的应用也是本发明保护的范围；所述钙调素结合蛋白的氨基酸序列为序列表的序列3；所述钙调素结合蛋白基因的核苷酸序列为序列表的序列4或序列表中序列4自5’末端第194-745位核苷酸。

序列1所示RNA或序列2所示的RNA在促进钙调素结合蛋白基因的mRNA降解中的应用也是本发明保护的范围；所述钙调素结合蛋白的氨基酸序列为序列表的序列3；所述钙调素结合蛋白基因的核苷酸序列为序列表的序列4或序列表中序列4自5’末端第194-745位核苷酸。其中，促进钙调素结合蛋白基因的mRNA降解为切割钙调素结合蛋白基因的mRNA。

序列1所示RNA或序列2所示的RNA在棉花纤维品质改良中的应用也是本发明保护的范围。