[发明专利]一种RNA的预备模板PCR检测方法有效
| 申请号: | 201210371539.9 | 申请日: | 2012-09-27 |
| 公开(公告)号: | CN102864233A | 公开(公告)日: | 2013-01-09 |
| 发明(设计)人: | 陈燃;伍迪;金晓铮 | 申请(专利权)人: | 浙江今复康生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
| 代理公司: | 杭州天正专利事务所有限公司 33201 | 代理人: | 黄美娟;冷红梅 |
| 地址: | 310052 浙江省杭州市滨*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 rna 预备 模板 pcr 检测 方法 | ||
1.一种RNA的预备模板PCR检测方法,所述方法包括:
(1)设计与目标RNA上任意一段序列互补的长度为25~40mer的单链寡核苷酸DNA,记为探针A;探针A的GC含量为40~60%,解链温度为70~85℃;将探针A锚定在PCR管内,得到锚定PCR管;
(2)设计部分序列与目标RNA上另一段任意序列互补的单链寡核苷酸DNA,其结构为: 两端是特异的长度为20~30mer的PCR引物序列、中间为与目标RNA互补的长度为25~40mer的序列,记为探针B;探针B 的GC含量为40~60%,解链温度为70~85℃,与探针A和目标RNA的结合区域互不重叠;
(3)取待测样本,加入探针B和含表面活性剂的细胞裂解液,反复吸打,转移至离心管中,冰上放置20min,4℃离心,取上清液,得到裂解上清液;
(4)取裂解上清液20uL至锚定PCR管中,60~70℃保温5~15min,吸干管内液体,以洗涤液洗涤3~9次,吸干,加入20uL 由PCR缓冲液和PCR引物配制的PCR反应液,进行PCR扩增,扩增产物进行荧光定量分析;
(5)以空白裂解液作为阴性对照,按照步骤(1)和(2)方法进行处理和分析,以样本Ct值小于空白裂解液Ct值判断为阳性。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于所述裂解液组成如下:1% SDS,500mmol/L NaCl,2mmol/L MgCl2,10mmol/L 2-巯基乙醇,0.1mg/ml 鱼精DNA,0.1% Tween20,1% 脱脂奶粉,溶剂为10mmol/L、pH7.5的Tris-HCl。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于所述PCR缓冲液组成如下:50mmol/L KCl,1.5mmol/L MgCl2,0.2mmol/L dNTP,5% DMSO,0.05% Tween20,0.4×SYBR Green I,0.5U/20ul Taq酶,溶剂为10mmol/L、pH9.0的Tris-HCl。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于所述洗涤液为TBST缓冲液。
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