[发明专利]甘蔗中性/碱性转化酶基因及其编码的蛋白质序列无效
申请号: | 201210338302.0 | 申请日: | 2012-09-13 |
公开(公告)号: | CN102888414A | 公开(公告)日: | 2013-01-23 |
发明(设计)人: | 王爱勤;牛俊奇;何龙飞;杨丽涛;李杨瑞 | 申请(专利权)人: | 广西大学 |
主分类号: | C12N15/52 | 分类号: | C12N15/52;C12N9/00 |
代理公司: | 广西南宁汇博专利代理有限公司 45114 | 代理人: | 邹超贤 |
地址: | 530005 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 甘蔗 中性 碱性 转化 基因 及其 编码 蛋白质 序列 | ||
技术领域
本发明属于生物工程技术领域,涉及一种甘蔗中性/碱性转化酶基因及其编码的蛋白质序列。
背景技术
高等植物组织中存在着多种转化酶的同工酶形式。根据最适pH可以分为两大类:酸性转化酶和中性/碱性转化酶。中性/碱性转化酶(Alkaline/Neutral Invertase)是一种胞质酶,最适pH值在7.0-8.0左右。该酶只以蔗糖为底物,能不可逆的把蔗糖分解为葡萄糖和果糖,用于能量代谢。在酸性转化酶和蔗糖合酶活性较低的植物组织中,中性/碱性转化酶能分解蔗糖,为三羧酸循环提供底物,因此它也被视为“维持酶”。
目前,已经在小麦、玉米、水稻、木薯、小果等植物中克隆得到该类酶的基因。由于其特殊的pH活性条件,酶活性极不稳定,在提取过程中容易丧失活力,导致纯化该类酶难度很大。己经纯化出来的中性或碱性转化酶主要以两种形式存在:八聚体和四聚体。中性或碱性转化酶N-端无信号肽、无糖基化,C-端富含半胱氨酸,且与酸性转化酶的同源性很低。研究发现重金属离子对中性/碱性转化酶没有抑制作用,而对酸性转化酶有抑制作用。因此,认为中性/碱性转化酶与酸性转化酶之间催化位点有明显差异。
研究发现,在胡萝卜不同发育期的各种组织都能检测到中性/碱性转化酶基因的表达,快速生长组织的表达量最高,表明中性/碱性转化酶可能与植物生长相关。乔永旭等认为甜瓜果实在成熟期之前,果实中转化酶活性逐渐降低。但是,只有当中性转化酶活性降低到一定程度之后,蔗糖才开始积累。刘永忠等认为柠檬细胞中的中性转化酶活性,随着果实成熟而下降,在成熟时保持极低水平,说明在果实成熟前,柠檬细胞中糖分的利用与中性转化酶活性有极大的关系。Qiet等(2007)运用图位克隆法在拟南芥突变体中克隆到1个中性/碱性转化酶基因,其在植物生长发育过程中发挥着多种作用,参与渗透胁迫诱导的抑制侧根的发育,抑制作用是通过控制细胞内己糖浓度实现的。Jia等研究发现,水稻短根突变体Oscyt-inv1的蔗糖含量增加时,己糖含量降低;外施葡萄糖能够恢复短根突变体Oscyt-inv1根的生长,表明OsCyt-inv1对水稻根系细胞发育和生殖发育有着重要的作用。
目前,对酸性转化酶的研究较多,而中性/碱性转化酶研究较少,仅在少数几种植物中克隆到中性/碱性转化酶基因全长序列,但到目前为止,还没有人在甘蔗上克隆到该基因。
发明内容
本发明的目的:为研究甘蔗中性/碱性转化酶基因的功能,应用甘蔗中性/碱性转化酶基因进行作物遗传改良,提供一种甘蔗中性/碱性转化酶基因及其编码蛋白序列。
本发明所采取的技术方案如下:
甘蔗中性/碱性转化酶基因及其编码蛋白序列,是在对所有植物中性/碱性转化酶基因全长序列进行进化分析的基础上,比对同一家族的中性/碱性转化酶基因cDNA序列,并设计扩增中性/碱性转化酶基因核心片段的引物,从甘蔗幼嫩叶片提取总RNA,并经反转录,用RT-PCR法扩增中性/碱性转化酶基因核心片段;在核心片段序列5′端设计三个特异引物,在核心片段序列3′端设计两个特异引物,通过RACE PCR技术分别扩增到中性/碱性转化酶基因核心区的5′端和3′端序列,三个序列经过拼接,获得甘蔗中性/碱性转化酶基因全长cDNA序列,总长2289bp,经VectorNTI软件分析,该基因的ORF为1812bp,编码603个氨基酸,起始密码子(ATG)位于287bp处,终止密码子(TAG)在2098bp之后还有一段191bp的带有真核生物典型的polyA尾巴的非编码序列。
本发明所获得的甘蔗中性/碱性转化酶基因核心区序列,是用以下核苷酸序列为引物扩增获得:
NIZJF2:(5′-gatcaggtgtttattcgggact-3′);
NIZJR2:(5′-gtcgtagtactccggccatttgtc-3′)。
本发明所获得的甘蔗中性/碱性转化酶基因5′端序列,是用以下核苷酸序列为引物,与5′-Full RACEKit(TAKARA)提供的引物结合,鸟巢式扩增获得:
NISYF1:(5′-cctcatcaccatcaagcggaat-3′);
NISYF2:(5′-ggcagtccattgtcttctccc-3′);
NISYF3:(5′-gaagtcccgaataaacacctgatc-3′)。
本发明所获得的甘蔗中性/碱性转化酶基因3′端的序列,是用以下核苷酸序列为引物,与3′-Full RACEKit(TAKARA)提供的引物结合,鸟巢式扩增获得:
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