[发明专利]一种水稻淀粉分支酶SBE3基因的突变基因及其用途

权利要求书

1.一种水稻淀粉分支酶SBE3基因的突变基因，其特征在于，所述突变基因在对应于水稻淀粉分支酶SBE3基因第16个外显子的第105位处具有T→C的碱基突变；

优选地，所述突变基因的核苷酸序列如SEQ ID NO. 1所示。

2.一种DNA核酸序列，其特征在于，所述DNA核酸序列的核苷酸序列如SEQ ID NO. 2所示。

3.根据权利要求1所述的突变基因或根据权利要求2所述的DNA核酸序列在筛选高抗性淀粉含量的水稻品种中的用途。

4.一种筛选高抗性淀粉含量的水稻品种的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

以扩增包含野生型水稻淀粉分支酶SBE3基因第16个外显子第105位的核酸序列为目标设计引物，然后采用该引物并以待筛选水稻的基因组DNA为模板进行PCR扩增，鉴定在得到的扩增产物中对应于水稻淀粉分支酶SBE3基因第16个外显子第105位处是否具有T→C的碱基突变。

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

1）提取待筛选水稻的基因组DNA；

2）以该基因组DNA为模板，采用核苷酸序列如SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 4所示的引物进行PCR扩增；以及

3）鉴定得到的扩增产物中在对应于水稻淀粉分支酶SBE3基因第16个外显子第105位处是否具有T→C的碱基突变。

6.根据权利要求4或5所述的方法，其特征在于，所述步骤3）中采用以下方式进行鉴定：

A. 对获得的扩增产物进行测序；和/或

B. 采用限制性内切酶SpeI对获得的扩增产物进行酶切鉴定。

7.一种用于筛选高抗性淀粉含量的水稻品种的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括：能够扩增包含水稻淀粉分支酶SBE3基因第16个外显子第105位的核酸序列的PCR引物；

优选地，所述试剂盒还包括Taq DNA聚合酶、PCR缓冲体系和dNTP。

8.根据权利要求6或7所述的试剂盒，其特征在于，所述PCR引物的核苷酸序列如SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 4所示；

优选地，所述试剂盒还包括限制性内切酶SpeI。

9.根据权利要求1所述的突变基因编码的蛋白；

优选地，所述蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO. 7所示。

10.根据权利要求2所述的DNA核酸序列编码的氨基酸序列。

11.根据权利要求9所述的蛋白或根据权利要求10所述的氨基酸序列在筛选高抗性淀粉含量的水稻品种中的用途。

12.一种筛选高抗性淀粉含量的水稻品种的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

获得待筛选水稻的水稻淀粉分支酶SBE3的氨基酸序列或其部分序列，然后鉴定该氨基酸序列中对应于水稻淀粉分支酶SBE3第599位处是否具有亮氨酸→脯氨酸的氨基酸突变。