[发明专利]EHBP1基因突变检测特异性引物和液相芯片

说明书

技术领域

本发明属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种EHBP1基因突变检测特异性引物和液相芯片。

背景技术

EHBP1基因称EH域结合蛋白1，英文名称为EH domain binding protein1，位于2号染色体2p15上，62900985到63273621碱基对之间。EHBP1基因包含一个假定的肌动蛋白结合调宁蛋白同源结构域，在一个完整的细胞上，该基因的高表达能够介导大量肌动蛋白的重组。EHBP1基因编码EPS15同源域蛋白，编码的蛋白在内吞作用白细胞聚集上发挥着作用，有研究表明，EHBP1基因的单核苷酸多态性与前列腺癌发生有关，EHBP1基因的缺陷可以导致机体对前列腺癌的遗传类型12（HPC12）的易感性，而大多数的前列腺癌是由前列腺导管腺癌发展而来的。

目前，EHBP1基因突变检测方法主要有：Illumina光纤微珠芯片技术、SNPlex Genotyping System技术和荧光定量PCR技术，虽然Illumina光纤微珠芯片技术是高灵敏度和精确性的高通量检测系统，但是自动化程度低，手工操作比较多，难以满足实际应用的需要，SNPlexTMSystem技术对SNP序列特异性要求较高,不能随意地分析所选择的单核苷酸多态性位点,难以应用于临床检测诊断，而且该方法操作比较复杂，不能满足实际应用的需要。荧光定量PCR技术灵敏度高、特异性强、自动化程度高的特点，但存在样品易污染、假阳性率高的缺点，且每次只能检测一种突变类型，同样不能满足实际应用的需要。

本发明目标检测的EHBP1基因突变位点，如表所示：

序号EHBP1基因位点突变的内容简写1SEQ ID NO.41的第177位核苷酸，发生C→T突变C177T2SEQ ID NO.42的第164位核苷酸，发生C→T突变C164T3SEQ ID NO.43的第158位核苷酸，发生C→A突变C158A6SEQ ID NO.44的第76位核苷酸，发生G→A突变G76A

SEQ ID NO.41突变位点：C177T

CTACGAGCACACACACCACACTTAGCTGATTTTTGAAAATATTTTTGTGGAGATGGGGGTCTCACTACGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGCTTCAAGCAACCCTCCCATCACAGACTCCCAAAGTGGTGGGATTATAGGCATGAGCCACTGCCTCTGGACTCACTGGCATCCATATAGCACATATTATGTTGTAGGCACTTTGCTAGACTCTAAAGTGATAAACAGACACTTATGGTAATGTTTTTGTTGTCGCTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACAATCTCAGCTTACTGCAGCCTCAACCTCCTAAACTCAAGCAATTCTCCCACCTCAGCCTCC

SEQ ID NO.42突变位点：C164T