[发明专利]一种细胞追踪统计分析系统及方法有效
申请号: | 201210209552.4 | 申请日: | 2012-06-25 |
公开(公告)号: | CN102799797A | 公开(公告)日: | 2012-11-28 |
发明(设计)人: | 李慧;付玲;崔权;张智红;骆清铭 | 申请(专利权)人: | 华中科技大学 |
主分类号: | G06F19/24 | 分类号: | G06F19/24;G06F19/26 |
代理公司: | 北京市德权律师事务所 11302 | 代理人: | 刘丽君 |
地址: | 430074 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 细胞 追踪 统计分析 系统 方法 | ||
1.一种细胞追踪统计分析系统,其特征在于,包括参数设置模块、基于二级参数的多样本比较分析模块、原点归一化轨迹分析模块和轨迹追踪分析模块;其中,所述参数设置模块分别与所述基于二级参数的多样本比较分析模块、所述原点归一化轨迹分析模块和所述轨迹追踪分析模块通过数据接口相连;
所述参数设置模块根据细胞显微光学成像图像和细胞追踪结果的原始数据设置样本的各项参数,所述各项参数包括:路径、图像尺寸、时间间隔和轨迹绘制范围;
所述基于二级参数的多样本比较分析模块根据所述参数设置模块设置的各项参数和所述细胞追踪结果的原始数据,计算细胞运动特性的二级参数,并绘制和显示所述二级参数的图像,所述二级参数包括平均速度、捕获系数、停滞比率、平均位移和能动系数;
所述原点归一化轨迹分析模块根据所述参数设置模块设置的各项参数和所述细胞追踪结果的原始数据,计算原点归一化的细胞运动轨迹坐标,绘制并显示原点归一化轨迹图;
所述轨迹追踪分析模块根据所述参数设置模块设置的各项参数,以及所述细胞显微光学成像图像和所述细胞追踪结果的原始数据,绘制并显示细胞运动原始轨迹图或细胞动态轨迹图。
2.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述细胞追踪统计分析系统还包括统计分析软件接口模块,所述统计分析软件接口模块与所述基于二级参数的多样本比较分析模块通过数据接口相连,所述统计分析软件接口模块用于存储所述基于二级参数的多样本比较分析模块计算的二级参数。
3.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述细胞追踪统计分析系统还包括工具条模块,所述工具条模块分别与所述基于二级参数的多样本比较分析模块、所述原点归一化轨迹分析模块和所述轨迹追踪分析模块通过数据接口相连,所述工具条模块用于对所述基于二级参数的多样本比较分析模块绘制的二级参数图像、所述原点归一化轨迹分析模块绘制的原点归一化轨迹图和所述轨迹追踪分析模块绘制的细胞运动原始轨迹图或细胞动态轨迹图进行放大、缩小和移动。
4.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述细胞追踪统计分析系统还包括滑块模块,所述滑块模块通过数据接口与所述原点归一化轨迹分析模块相连,所述滑块模块用于切换显示各样本的原点归一化轨迹图。
5.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述轨迹追踪分析模块包括标记属性设置单元、轨迹类型设置单元、轨迹输出格式设置单元和原始轨迹分析单元;其中,所述原始轨迹分析单元分别与所述标记属性设置单元、所述轨迹类型设置单元和所述轨迹输出格式设置单元通过数据接口相连,所述轨迹输出格式设置单元与所述参数设置模块通过数据接口相连;
所述标记属性设置单元用于设置标记物和标记线的属性,其中,所述标记物用于标记所述细胞显微光学成像图像每一帧中细胞质心所在的位置,所述标记线用于连接所述细胞显微光学成像图像每一帧中对应于同一细胞的标记物;
所述轨迹类型设置单元用于设置输出轨迹的类型,所述输出轨迹的类型包括细胞运动原始轨迹图和细胞动态轨迹图;
所述轨迹输出格式设置单元用于选择轨迹输出格式和设置对应于所选轨迹输出格式的数据属性;所述轨迹输出格式包括动画格式、图像序列格式和特定帧格式;所述对应于所选轨迹输出格式的数据属性包括数据输出帧范围、动画帧速率、图像格式、特定帧帧序号;
所述原始轨迹分析单元首先根据所述标记属性设置单元设置的所述标记物和标记线的属性以及所述细胞追踪结果的原始数据,标记出细胞运动的原始轨迹,然后根据所述轨迹类型设置单元设置的所述输出轨迹的类型,选择是否叠加所述细胞显微光学成像图像,最后根据所述轨迹输出格式设置单元选择的所述轨迹输出格式和设置的所述对应于所选轨迹输出格式的数据属性,绘制并显示所述细胞运动原始轨迹图或所述细胞动态轨迹图。
6.根据权利要求5所述的系统,其特征在于,所述标记物的属性包括标记物的形状、标记物的大小和标记物的颜色,所述标记线的属性包括标记线的线形、标记线的线宽和标记线的颜色。
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