[发明专利]等温扩增检测猴痘病毒的试剂及等温扩增检测猴痘病毒的方法有效
申请号: | 201210209069.6 | 申请日: | 2012-06-21 |
公开(公告)号: | CN102839224A | 公开(公告)日: | 2012-12-26 |
发明(设计)人: | 吕沁风;郑伟;吴忠华;徐琦;罗鹏;何蕾 | 申请(专利权)人: | 浙江国际旅行卫生保健中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 | 代理人: | 刘晓春 |
地址: | 310003 *** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 等温 扩增 检测 痘病毒 试剂 方法 | ||
1.一种等温扩增检测猴痘病毒的试剂,其特征在于,它包括:
(1)检测猴痘病毒的标准品,所述标准品为采用人工合成的基因片段,克隆入pGSI质粒,得到的重组质粒载体;所述基因片段的碱基序列如SEQ ID NO:1所示;
(2)引物,其基因碱基序列:
外引物F3:5′-CATTGATTTTTCGCGGGATA-3′;
外引物B3:5′-TCCATCTCCTCCAGAATCTCC-3′;
内引物FIP:
5′-GTTGGTCTACGACAATGGATGCTCATCAGAATCTGTAGGCCGTGT-3′;
内引物BIP:
5′-TCCTTAGTCCAATGTTTTTAATAACCGAAAAATTTCTACGATCTATATTGACGAG-3′。
2.一种等温扩增检测猴痘病毒的方法,其特征在于:
它的反应体系25μl,包括10×buffer2.5μl,引物混合物1μl,模板DNA1μl,8U BstDNA聚合酶0.8μl,甜菜碱(8M)2μl,dNTP(10mM)2μl,MgSO4(100mM)1.2μl,1.25μl荧光染料20×Eva Green,加入ddH2O补足25μl;反应体系中引物终浓度分别如下:外引物F3和外引物B3各40pM,内引物FIP和内引物BIP各800pM;
将上述反应体系在水浴箱上63℃90分钟,或者在荧光定量PCR仪上63℃1分钟,90个循环,同时进行待测样本、阴性对照和阳性对照的扩增,其中阴性对照采用双蒸水,阳性对照采用权利要求1所述的检测猴痘病毒的标准品;
反应结束后,取扩增产物观察电泳结果,阳性对照孔产生阶梯状的条带,阴性对照孔则没有条带产生,待测样本孔中如产生阶梯状条带则含有猴痘病毒,反之没有猴痘病毒;或者,反应结束后,反应管离心6000rpm,3分钟,观察结果,阳性对照管可见白色沉淀,阴性对照管没有产生沉淀,样本管中如产生白色沉淀则含有猴痘病毒,反之没有猴痘病毒;或者紫外灯下观察荧光强度的变化,阳性对照产生强烈绿色荧光,阴性对照荧光强度没有变化,样本管中如产生强烈绿色荧光则含有猴痘病毒,反之没有猴痘病毒。
3.如权利要求2所述的一种等温扩增检测猴痘病毒方法,其特征在于:
待测样本被检测出阳性后,所述方法通过对比标准曲线来对待测样本进行猴痘病毒的浓度检测;所述浓度检测包括以下步骤:
将待测样本和稀释至不同浓度的权利要求1所述的检测猴痘病毒的标准品同时按权利要求2所述的反应体系,在荧光定量PCR仪上进行扩增,反应程序63℃1分钟,90个循环,读取荧光值,阴性对照采用灭菌双蒸水,反应结束后根据得到所述标准品的各个浓度的循环阈值C(t),采用计算机自动绘制标准曲线;
通过对比标准曲线来对待测样本进行猴痘病毒的浓度检测,将待测样本循环阈值C(t)与所述标准曲线对照,得到待测样本DNA中的靶基因片段拷贝浓度,按照所述拷贝浓度判断待测样本中猴痘病毒的浓度。
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