[发明专利]一种巢式PCR法检测叶点霉属真菌的引物组及方法有效
| 申请号: | 201210157397.6 | 申请日: | 2012-05-18 |
| 公开(公告)号: | CN102649980A | 公开(公告)日: | 2012-08-29 |
| 发明(设计)人: | 王兴红;黄峰;侯欣;李红叶 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/645 |
| 代理公司: | 杭州天勤知识产权代理有限公司 33224 | 代理人: | 胡红娟 |
| 地址: | 310027 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 pcr 检测 叶点霉属 真菌 引物 方法 | ||
1.一种巢式PCR法检测叶点霉属真菌的引物组,其特征在于,包括四对引物:
第一对引物:上游引物的碱基序列如SEQ ID NO.1所示,下游引物的碱基序列如SEQ ID NO.5所示;
第二对引物:上游引物的碱基序列如SEQ ID NO.2所示,下游引物的碱基序列如SEQ ID NO.5所示;
第三对引物:上游引物的碱基序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物的碱基序列如SEQ ID NO.5所示;
第四对引物:上游引物的碱基序列如SEQ ID NO.4所示,下游引物的碱基序列如SEQ ID NO.5所示。
2.一种巢式PCR法检测叶点霉属真菌的方法,包括:
(1)提取待测菌的DNA;
(2)以提取的DNA为模板,利用真菌通用引物ITS4/ITS5进行第一轮PCR扩增;
(3)将第一轮PCR扩增得到的产物稀释50-100倍,以稀释后的产物为模板,利用权利要求1所述的四对引物进行第二轮PCR扩增;
(4)将第二轮PCR扩增产物进行凝胶电泳分离、染色,根据扩增条带判定待测菌的种类。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述的真菌通用引物ITS4/ITS5在第一轮PCR扩增反应体系中的终浓度为0.2-0.3mmol/L。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述的真菌通用引物ITS4/ITS5在第一轮PCR扩增反应体系中的终浓度为0.25mmol/L。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述的第一轮PCR扩增的反应条件为:94℃预变性3min;94℃变性30s,52℃退火30s,72℃延伸1min,进行34个循环;最后72℃延伸10min。
6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述的四对引物在第二轮PCR扩增反应体系中的终浓度分别为:
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述的四对引物在第二轮PCR扩增反应体系中的终浓度分别为:
8.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述的第二轮PCR扩增的反应条件为:94℃预变性3min;94℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸1min,进行34个循环;最后72℃延伸10min。
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