[发明专利]一种巢式PCR法检测叶点霉属真菌的引物组及方法有效

专利信息
申请号: 201210157397.6 申请日: 2012-05-18
公开(公告)号: CN102649980A 公开(公告)日: 2012-08-29
发明(设计)人: 王兴红;黄峰;侯欣;李红叶 申请(专利权)人: 浙江大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/645
代理公司: 杭州天勤知识产权代理有限公司 33224 代理人: 胡红娟
地址: 310027 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 pcr 检测 叶点霉属 真菌 引物 方法
【权利要求书】:

1.一种巢式PCR法检测叶点霉属真菌的引物组,其特征在于,包括四对引物:

第一对引物:上游引物的碱基序列如SEQ ID NO.1所示,下游引物的碱基序列如SEQ ID NO.5所示;

第二对引物:上游引物的碱基序列如SEQ ID NO.2所示,下游引物的碱基序列如SEQ ID NO.5所示;

第三对引物:上游引物的碱基序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物的碱基序列如SEQ ID NO.5所示;

第四对引物:上游引物的碱基序列如SEQ ID NO.4所示,下游引物的碱基序列如SEQ ID NO.5所示。

2.一种巢式PCR法检测叶点霉属真菌的方法,包括:

(1)提取待测菌的DNA;

(2)以提取的DNA为模板,利用真菌通用引物ITS4/ITS5进行第一轮PCR扩增;

(3)将第一轮PCR扩增得到的产物稀释50-100倍,以稀释后的产物为模板,利用权利要求1所述的四对引物进行第二轮PCR扩增;

(4)将第二轮PCR扩增产物进行凝胶电泳分离、染色,根据扩增条带判定待测菌的种类。

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述的真菌通用引物ITS4/ITS5在第一轮PCR扩增反应体系中的终浓度为0.2-0.3mmol/L。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述的真菌通用引物ITS4/ITS5在第一轮PCR扩增反应体系中的终浓度为0.25mmol/L。

5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述的第一轮PCR扩增的反应条件为:94℃预变性3min;94℃变性30s,52℃退火30s,72℃延伸1min,进行34个循环;最后72℃延伸10min。

6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述的四对引物在第二轮PCR扩增反应体系中的终浓度分别为:

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述的四对引物在第二轮PCR扩增反应体系中的终浓度分别为:

8.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述的第二轮PCR扩增的反应条件为:94℃预变性3min;94℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸1min,进行34个循环;最后72℃延伸10min。

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