[发明专利]一种基于统计显著性能快速识别基因组转录因子结合位点的系统

权利要求书

1.这种预测基因组转录因子结合位点的预测方法，其特征在于，通过统计显著性的方式，将基因组启动子区的转录因子结合位点的信息进行预测。

2.首先是统计K字串的数目与隐马尔科夫模型的背景K-字串的数目进行比较，得到统计显著性字符串。

3.其次，收集统计显著性得分高的K串作为转录因子结合位点的种子，进行聚类，计算转录因子结合位点的权重矩阵。

4.如权利要求1所述的系统，其特征在于，统计K字串的出现的实际频率，得到K串的实际频率分布。

5.如权利要求2所述的系统，其特征在于，计算隐马模型背景概率条件下，各K串出现的背景概率分布，该统计方法还包括一个隐马模型的建立和参数训练的过程。

6.如权利要求3所述的系统，其特征在于，聚类算法的实现，把具有编辑距离小于1的统计显著性K串，按其基本形态，进行聚类，并构建通用的权重矩阵。

7.如权利要求3所述的系统，还包括一个自适应迭代算法的实现用于更新权重矩阵的参数，保持权重矩阵的形态特征。

8.如权利要求3所述的方法，还包括一个P值和Z值指标的计算，用于统计显著性标志物的度量。