[发明专利]生物传感器及其DNA测序方法有效
申请号: | 201210155446.2 | 申请日: | 2012-05-18 |
公开(公告)号: | CN103424457A | 公开(公告)日: | 2013-12-04 |
发明(设计)人: | 赵超;董立军 | 申请(专利权)人: | 中国科学院微电子研究所 |
主分类号: | G01N27/414 | 分类号: | G01N27/414;G01N27/447 |
代理公司: | 中科专利商标代理有限责任公司 11021 | 代理人: | 王波波 |
地址: | 100083 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 生物 传感器 及其 dna 方法 | ||
技术领域
本发明涉及场效应晶体管(FET)型生物传感器及DNA测序方法,更具体地,涉及用于DNA测序的FET型生物传感器及DNA测序方法。
背景技术
DNA测序(DNA sequencing)是分析特定DNA片段的碱基序列的排列方式的技术。该技术的主要发展方向是在提高测序通量(测序数据量)的同时,降低原始数据中每个碱基的测序成本,以使该技术的广泛应用成为可能,例如用于个人基因组测序,宏基因组学研究,以及对大量重要物种的测序。
纳米孔测序(nanopore sequencing)是新一代的DNA测序技术。该技术利用电泳驱使DNA分子通过纳米孔,并且利用阻塞电流法、隧道电流法、电容法等检测不同类型的碱基序列所导致的物理参数变化。由于纳米孔的直径限制,每次仅一个DNA单链通过纳米孔,这可以实现高通量和高准确度的测序。在电场的作用下,甚至长达1000个碱基的DNA分子可以通过纳米孔,这可以实现大测序长度。而且,纳米孔测序不需要进行DNA扩增和标记,这避免了繁琐的文库制备过程,不仅提高了测序速度,而且降低了测序成本。
在纳米孔测序中,DNA分子高速(大约微秒的量级)通过纳米孔,一方面提高了测序速度,另一方面导致信号检测信号微弱(大约PA的量级)。因此,在纳米孔测序中需要使用高灵敏度的读出电路,例如由FET组成的读出电路,以控制热噪声和提高信噪比。
在纳米孔测序中仍然期望提供可以高灵敏度地检测DNA的碱基序列的生物传感器。
发明内容
本发明的目的是提供一种可以在DNA测序中提高检测灵敏度的生物传感器及DNA测序方法。
根据本发明的一方面,提供一种生物传感器,包括:源电极;漏电极;位于源电极和漏电极之间的沟道区,其中该沟道区由半导体纳米线的至少一部分形成;在沟道区中穿透半导体纳米线的纳米孔;以及位于纳米孔的内壁处的栅极介质层,其中纳米孔的直径设置为使得可以通过DNA分子。
根据本发明的另一方面,提供一种采用上述生物传感器进行DNA测序的方法,包括:利用电泳驱动DNA分子通过纳米孔;在DNA分子通过纳米孔时,在源电极和漏电极上测量沟道区的电导;以及根据DNA分子导致的沟道区的电导变化,确定DNA分子中的碱基序列的类型。
本发明的生物传感器直接基于场效应,在该生物传感器的沟道中的纳米孔中通过的DNA分子起到栅极的作用。该生物传感器的沟道区的电导受到碱基序列的表面电荷(正或负)的影响。该电导是碱基序列的表面电荷的响应信号,进而可以表征碱基序列的类型。该生物传感器利用场效应可以提供高信噪比的输出,实现高检测灵敏度,从而可以应用于纳米孔测序。
附图说明
图1a和1b分别示出根据本发明的生物传感器的俯视图和截面图,其中该截面图沿图1中的线A-A截取。
图2示出根据本发明的生物传感器的等效电路图。
图3示出根据本发明的DNA测序方法的流程图。
具体实施方式
以下将参照附图更详细地描述本发明。在各个附图中,相同的元件采用类似的附图标记来表示。为了清楚起见,附图中的各个部分没有按比例绘制。
应当理解,在描述器件的结构时,当将一层、一个区域称为位于另一层、另一个区域“上面”或“上方”时,可以指直接位于另一层、另一个区域上面,或者在其与另一层、另一个区域之间还包含其他的层或区域。并且,如果将器件翻转,该一层、一个区域将位于另一层、另一个区域“下面”或“下方”。
如果为了描述直接位于另一层、另一个区域上面的情形,本文将采用“直接在......上面”或“在......上面并与之邻接”的表述方式。
在本申请中,术语“半导体结构”指在制造半导体器件的各个步骤中形成的整个半导体结构的统称,包括已经形成的所有层或区域。
在下文中描述了本发明的许多特定的细节,例如器件的结构、材料、尺寸、处理工艺和技术,以便更清楚地理解本发明。但正如本领域的技术人员能够理解的那样,可以不按照这些特定的细节来实现本发明。
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