[发明专利]基因突变检测用探针无效
申请号: | 201210132171.0 | 申请日: | 2012-04-27 |
公开(公告)号: | CN102766683A | 公开(公告)日: | 2012-11-07 |
发明(设计)人: | 平井光春;黑瀬熏;井口亚希 | 申请(专利权)人: | 爱科来株式会社 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64 |
代理公司: | 北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 11258 | 代理人: | 肖善强 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基因突变 检测 探针 | ||
1.一种基因突变检测用探针,用于检测对含有目标基因突变和非目标基因突变的对象基因进行编码的碱基序列中的所述目标基因突变,所述探针包括从下述P1、P1-1、P1’及P1’-1的组中选择的至少一种寡核苷酸:
(P1)寡核苷酸,其在对应于所述目标基因突变的碱基位置处具有与所述目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任意一者互补的碱基,并且在对应于所述非目标基因突变的碱基位置处具有与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均非互补的碱基,而且其相对于与编码所述对象基因的碱基序列的全部或部分互补的碱基序列具有至少80%以上的同一性;
(P1-1)寡核苷酸,其在对应于所述目标基因突变的碱基位置处具有与所述目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任意一者互补的碱基,并且在对应于所述非目标基因突变的碱基位置处具有与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均非互补的碱基,而且其与和编码所述对象基因的碱基序列具有相同碱基序列的寡核苷酸在严谨条件下杂交;
(P1’)寡核苷酸,其在对应于所述目标基因突变的碱基位置处具有与所述目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任意一者相同的碱基,并且在对应于所述非目标基因突变的碱基位置处具有与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均不同的碱基,而且其相对于与编码所述对象基因的碱基序列的全部或部分具有至少80%以上的同一性;以及
(P1’-1)寡核苷酸,其在对应于所述目标基因突变的碱基位置处具有与所述目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任意一者相同的碱基,并且在对应于所述非目标基因突变的碱基位置处具有与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均不同的碱基,而且其与具有与编码所述对象基因的碱基序列互补的碱基序列的寡核苷酸在严谨条件下杂交。
2.根据权利要求1所述的基因突变检测用探针,其中,所述基因突变检测用探针满足下述(a)至(f)中的任一条件:
(a)在所述非目标基因突变的碱基位置的野生型碱基为A和T中的一者,并且所述非目标基因突变的突变型碱基为A和T中的另一者的情况下,与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均非互补的碱基或者与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均不同的碱基为C或G;
(b)在所述非目标基因突变的碱基位置的野生型碱基为C和G中的一者,并且所述非目标基因突变的突变型碱基为C和G中的另一者的情况下,与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均非互补的碱基或者与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均不同的碱基为A或T;
(c)在所述非目标基因突变的碱基位置的野生型碱基为A和C中的一者,并且所述非目标基因突变的突变型碱基为A和C中的另一者的情况下,与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均非互补的碱基或者与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均不同的碱基为T或G;
(d)在所述非目标基因突变的碱基位置的野生型碱基为从A和G中的一者,并且所述非目标基因突变的突变型碱基为A和G中的另一者的情况下,与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均非互补的碱基或者与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均不同的碱基为T或C;
(e)在所述非目标基因突变的碱基位置的野生型碱基为T和C中的一者,并且所述非目标基因突变的突变型碱基为T和C中的另一者的情况下,与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均非互补的碱基所述非互补的碱基为T或C,与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均不同的碱基为A或G;
(f)在所述非目标基因突变的碱基位置的野生型碱基为T和G中的一者,并且所述非目标基因突变的突变型碱基为T和G中的另一者的情况下,与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均非互补的碱基为T或G,与所述非目标基因突变的野生型碱基和突变型碱基中任何一者均不同的碱基为A或C。
3.根据权利要求1所述的基因突变检测用探针,其中,所述寡核苷酸为荧光标记寡核苷酸。
4.根据权利要求3所述的基因突变检测用探针,其中,所述荧光标记寡核苷酸的3’末端或5’末端的碱基为胞嘧啶,该胞嘧啶用荧光染料标记。
5.根据权利要求3所述的基因突变检测用探针,其中,所述荧光标记寡核苷酸位于从3’末端或5’末端起数第1~3位的任意位置。
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