[发明专利]修饰核苷单体及其合成方法和应用有效

专利信息
申请号: 201210130023.5 申请日: 2012-04-27
公开(公告)号: CN103232507A 公开(公告)日: 2013-08-07
发明(设计)人: 杨振军;王晓锋;刘洋;张礼和 申请(专利权)人: 北京大学
主分类号: C07H19/073 分类号: C07H19/073;C07H1/00;C12N15/113;C12N15/10
代理公司: 北京科龙寰宇知识产权代理有限责任公司 11139 代理人: 孙皓晨
地址: 100871*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 修饰 核苷 单体 及其 合成 方法 应用
【说明书】:

技术领域

发明涉及一类修饰核苷单体,还涉及合成方法及其在寡核苷酸缀合物合成中的应用。本发明属于合成化学领域。

背景技术

基于核酸的一些药物如反义寡核苷酸、肽核酸以及很有希望的小干扰RNA(siRNA)要想发展成为有用的治疗药物,提高其细胞通透性是必须解决的关键问题之一。很多技术已经被用来提高这类化合物的细胞内摄取,例如,高压静脉注射、脂质体和纳米聚合物等,但是这些方法都存在不同程度的副作用而限制其发展。

细胞透膜性肽是近些年来发展起来的新兴转运载体,已经广泛用于一些非细胞膜通透性大分子的细胞内转运。而将其用于核酸类药物细胞内转运来说,主要通过将透膜性肽与寡核苷酸共价缀合实现的。用化学方法实现缀合物生成主要有三种方法:固相逐步合成法、固相片段缩合法和液相片段缩合法。在这三种方法中,固相逐步合成法具有操作简便,底物用量少等优点。

发明内容

为了解决现有技术中的问题,本发明的目的在于提供两类新的核苷修饰单体,该单体能够方便地用于多肽共价缀合寡核苷酸的合成中,并且在多肽和寡核苷酸之间构建二硫连接基或三氮唑连接基。

为了达到上述目的,本发明采用如下技术方案:

本发明的一个方面,提供的修饰核苷单体具有如式I或式II的结构:

其中的糖为L-构型或者D-构型;所述X为O或S-S;所述R1为羟基、氢、取代羟基、氨基,取代氨基、巯基和或取代巯基,R2为具有紫外吸收的保护基,R3为氢,天然的嘌呤、嘧啶碱基,非天然或人工修饰合成的嘌呤、嘧啶碱基;

R4为-R-NH2、-R-COOH、其中R为C1-C8的低级烷基、链烯基、链炔基、芳基、芳烷基或者含有杂原子的上述基团。

在本发明中,优选的R1为氢、羟基或氨基,R2为苯甲酰基、4,4’-二甲氧基三苯甲基或单甲氧基三苯甲基;

R3为其中R5为甲基、氢、卤素或取代卤素,R6为羟基、氨基、氢、甲基、卤素或取代卤素;R4为-R-NH2或其中R是C1-C8的低级烷基。

更优选的,R3为嘧啶碱基,R为甲基或乙基。

本发明还提供了一种合成所述的修饰核苷单体的方法,其特征在于当式I或式II中的X为S-S时,包括如下步骤:

1)脱氧尿嘧啶溶于无水吡啶,冰浴条件下加入DMTrCl,室温搅拌反应3小时,得到5′-氧-(4,4′-二甲氧基三苯甲基)-2′-脱氧尿嘧啶核苷,即为化合物1;

2)将化合物1溶于无水吡啶,冰浴条件下缓慢滴加MsCl,室温反应6小时,蒸干溶剂,二氯甲烷萃取,将蒸干后的残余溶于无水乙腈,加入碳酸钾,85℃回流2小时,得到5′-氧-4,4′-二甲氧基三苯甲基-2,3′-脱水-2′-脱氧尿嘧啶,即为化合物2;

3)将化合物2溶于无水DMF中,每隔30分钟加入硫代苯甲酸钠,110℃回流3小时,得到5′-氧-4,4′-二甲氧基三苯甲基-3′-S-苯甲酰基-2′-脱氧尿嘧啶,即为化合物3;

4)将化合物3和2-(2-吡啶基二巯基)-乙基胺溶于0.4M的氢氧化钠乙醇溶液中,氩气保护下,室温反应6小时,得到5′-氧-(4,4′-二甲氧基三苯甲基)-3′-(2-乙基二硫基)-2′-脱氧尿嘧啶,即为化合物4;

5)将化合物3和3-(2-吡啶巯基)-丙酸溶于0.4M氢氧化钠乙醇溶液中,氩气保护下,室温反应3小时,得到5′-氧-(4,4′-二甲氧基三苯甲基)-2′-脱氧-3′-硫-(1-丙酸)-3′-尿嘧啶,即为化合物5。

当式I或式II中的X为O时,包括如下步骤:

1)脱氧尿嘧啶溶于无水吡啶,冰浴条件下加入DMTrCl,室温搅拌反应3小时,得到5′-氧-(4,4′-二甲氧基三苯甲基)-2′-脱氧尿嘧啶核苷,即为化合物1;

2)将化合物1与无水碳酸钾混合在无水乙腈中,加入3-溴丙炔,50℃搅拌反应10小时,得到5′-氧-(4,4′-二甲氧基三苯甲基)-3′-氧-(2-丙炔基)-2′-脱氧尿嘧啶核苷。

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