[发明专利]一种核酸测序信息处理系统及方法

权利要求书

1.一种核酸测序信息的处理系统，其特征在于，所述系统包括：短片段建立单元、数据库建立单元和序列匹配单元；

所述短片段建立单元，用于将每条核酸序列片段进行分段建立短片段，并将每条核酸序列片段分段所得的短片段发给数据库建立单元和序列匹配单元；

所述数据库建立单元，用于根据短片段的长度建立并存储参考序列索引，得数据库；

所述序列匹配单元，用于将每条核酸序列片段分段建立的短片段分别单独在数据库中进行匹配，得匹配结果。

2.根据权利要求1所述的核酸测序信息的处理系统，其特征在于，所述短片段建立单元包括第一决策模块和第一分段模块；

所述第一决策模块，用于获取最短的一条核酸序列片段，并将该核酸序列片段和该核酸序列片段的碱基个数发给第一分段模块；

所述第一分段模块，用于对最短的一条核酸序列片段进行分段得多条短片段，并完成其他核酸序列片段的分段建立短片段；所述其他核酸序列的分段方式与最短的一条核酸序列片段分段方式相同。

3.根据权利要求2所述的核酸测序信息的处理系统，其特征在于，所述数据库建立单元包括第一索引模块和第一标引模块；

所述第一索引模块，用于建立长度与短片段等长的参考序列索引，并将参考序列索引发给第一标引模块；

所述第一标引模块，用于对参考序列索引按顺序进行标记，得数据库；

所述数据库中参考序列索引中任意相邻的两个索引，前一个索引的第2到最后一位的碱基和后一索引的第1到倒数第二位的碱基相同。

4.根据权利要求1所述的核酸测序信息的处理系统，其特征在于，所述短片段建立单元包括第二决策模块和第二分段模块；

所述第二决策模块，用于按长度对核酸序列片段进行分类，得多类核酸序列片段，并将结果发给第二分段模块；

所述第二分段模块，用于对每类核酸序列片段中最短的一条核酸序列片段进行分段得多条短片段，并完成该类其他核酸序列片段的分段建立短片段；所述其他核酸序列的分段方式与每类核酸序列片段中最短的一条核酸序列片段分段方式相同。

5.根据权利要求4所述的核酸测序信息的处理系统，其特征在于，所述数据库建立单元包括第二索引模块和第二标引模块；

所述第二索引模块，用于根据每类核酸序列片段建立的短片段的长度建立参考序列索引，并将结果发给第二标引模块；

所述第二标引模块，用于对所述每类参考序列索引分别按顺序进行标记，得每类核酸序列片段对应的数据库。

6.根据权利要求1至5中任一项所述的核酸测序信息的处理系统，其特征在于，所述系统还包括碱基识别单元或核酸测序单元中的一个，和/或数据输出单元；

所述碱基识别单元，用于识别碱基，得核酸序列片段，并将识别的核酸序列片段发送给短片段建立单元；

所述核酸测序单元，用于对核酸进行测序，得核酸序列片段，并将核酸序列片段发给短片段建立单元；

所述数据输出单元，用于输出匹配结果。

7.一种核酸测序信息的处理方法，其特征在于，包括以下步骤：

A、将每条核酸序列片段进行分段，建立短片段；

B、根据短片段的长度建立并存储参考序列索引，得数据库；

C、把每条核酸序列片段分段建立的短片段分别单独在数据库中进行匹配，得匹配结果。

8.根据权利要求7所述的核酸测序信息的处理方法，其特征在于，在所述步骤A中，允许每条核酸序列片段中不匹配的碱基个数为N，则每条核酸序列片段至少分成N+1段，得每条核酸序列片段的至少N+1条短片段；其中，N为自然数。

9.根据权利要求8所述的核酸测序信息的处理方法，其特征在于，所述步骤A包括：

A1、获取核酸序列片段中最短的一条核酸序列片段，长度为x；

A2、对最短的一条核酸序列片段进行分段，x/（N+φ）=y……m；

A3、将每条核酸序列片段依次分成长度为y的短片段，若核酸序列片段有剩余且剩余长度小于y，则将剩余的部分单独作为一条短片段；

所述x为最短的一条核酸序列片段的碱基个数；x，y，φ均为正整数，m为小于y的自然数。