[发明专利]一种藻类RNA提取剂及使用方法有效
申请号: | 201210111477.8 | 申请日: | 2012-04-17 |
公开(公告)号: | CN102807978A | 公开(公告)日: | 2012-12-05 |
发明(设计)人: | 付万冬;廖妙飞;周宇芳;杨会成 | 申请(专利权)人: | 浙江省海洋开发研究院 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 杭州杭诚专利事务所有限公司 33109 | 代理人: | 尉伟敏 |
地址: | 316100 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 藻类 rna 提取 使用方法 | ||
1. 一种藻类RNA提取剂,其特征在于,所述藻类RNA提取剂由Tris-HCl、NaCl、EDTA、CTAB、DTT、和柠檬酸钠溶于DEPC水溶液中而成;其中,Tris-HCl的终浓度为0.05-0.2 mol/L,NaCl的终浓度为1.5-2.5 mol/L,EDTA的终浓度为0.03-0.06 mol/L,CTAB的终浓度为0.05-0.15 mmol/L,柠檬酸钠的终浓度为25-30 mmol/L,藻类RNA提取剂的终浓度为30-80 mmol/L。
2.根据权利要求1所述的一种藻类RNA提取剂,其特征在于,所述DEPC水溶液的质量分数为0.1%-0.2%。
3.一种权利要求1所述的藻类RNA提取剂应用于提取藻类RNA的使用方法,其特征在于,所述使用方法包括以下步骤:
步骤a)处理样品:将新鲜或超低温冷冻的藻类,用纯净水冲洗干净,然后沥干;取沥干后的藻类0.1-0.5g,在液氮中研磨至粉末状;
步骤b)配制提取剂:向Tris-HCl、NaCl、EDTA、CTAB与柠檬酸钠中加入质量分数为0.1-0.2%的DEPC水溶液,然后在室温下静置过夜,在121℃灭菌15-20min,得到提取剂半成品;向提取剂半成品中加入2-4mol/L 的DTT至终浓度30-80m mol/L,得到提取剂;其中Tris-HCl的终浓度为0.05-0.2 mol/L,NaCl的终浓度为1.5-2.5 mol/L,EDTA的终浓度为0.03-0.06 mol/L,CTAB的终浓度为0.05-0.15 mmol/L,柠檬酸钠的终浓度为25-30 mmol/L;
步骤c)抽提:将步骤a)的粉末状样品倒入盛有2-4mL提取剂的离心管中,涡旋混匀2-4min,将离心管在室温下放置15-30min,期间每隔5min摇晃离心管一次;然后向离心管中加入2-4mL的氯仿与异戊醇的混合液,涡旋混匀2-4min,然后于0-4℃,离心力10000-15000g的条件下离心15-30min;吸取上清液于另一干净离心管内,加入上清液体积20%-40%的无水乙醇,涡旋混匀2-4min;然后向加入了无水乙醇的上清液中加入2-4mL的氯仿与异戊醇的混合液,涡旋混匀2-4min,于0-4℃,离心力10000-15000g的条件下离心15-30min;
步骤d):吸取步骤c)抽提后的上清液于干净离心管内,加入上清液体积20%-40%的12 mol/L LiCl溶液并涡旋混匀2-4min,-50—-80℃条件下静置30-60min,得到粗样品;
步骤e)沉淀:将步骤d)静置后的粗样品于0-4℃,离心力12500-15000g的条件下,离心20-40 min;弃上清液,取出沉淀,用0.5-2mL的体积分数70%-75%的乙醇溶液清洗沉淀,之后于0-4 ℃下,离心力12000g,离心10 min;
步骤f):将步骤e)中的上清液于于0-4℃,离心力12500-15000g的条件下,离心20-40 min,取出沉淀,用0.5-2mL体积分数70%-75%的乙醇溶液清洗沉淀,之后于0-4 ℃下,离心力12000g,离心10 min将该次离心得到的沉淀与步骤e)得到的沉淀合并得到粗沉淀;
步骤g):将步骤f)处理后的粗沉淀在10-30℃下风干,然后用20-50μL的质量分数0.1%-0.2%的DEPC水溶液溶解风干后的沉淀,用RNase-Free DNase set(50)试剂盒去除样品总RNA中DNA;
步骤h):将步骤g)去除DNA后的样品总RNA移入干净离心管,加入与样品总RNA等体积的氯仿与异戊醇混合液进行抽提,0-4 ℃,离心力12000g的条件下离心10 -25min;取上清液,移入新离心管内,加入上清液体积10%-15%的3-5 mol/L的醋酸钠溶液,调节溶液的pH4-5,然后加入2-3倍上清液体积的无水乙醇,在-70℃冰浴沉淀45-60min;然后在0-4 ℃,离心力12,000g的条件下离心10 min,弃上清液,沉淀即为纯化的藻类RNA。
4.根据权利要求3所述的一种藻类RNA应用于藻类RNA提取的使用方法,其特征在于,所述步骤c)与步骤h)中氯仿与异戊醇的体积比为24:1。
5.根据权利要求3或4所述的一种藻类RNA应用于藻类RNA提取的使用方法,其特征在于,所述步骤a)中所用藻类为红藻、绿藻或褐藻。
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