[发明专利]一种针对整合酶核心区去整合反应的整合酶抑制剂体外筛选方法有效
申请号: | 201210109278.3 | 申请日: | 2012-04-13 |
公开(公告)号: | CN102618654A | 公开(公告)日: | 2012-08-01 |
发明(设计)人: | 何红秋;贾渝跃;乐涛;牛小东 | 申请(专利权)人: | 重庆市科学技术研究院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/25;G01N21/64 |
代理公司: | 重庆市前沿专利事务所 50211 | 代理人: | 郭云 |
地址: | 401123 重庆市渝*** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 针对 整合 核心区 反应 抑制剂 体外 筛选 方法 | ||
1.一种针对整合酶核心区去整合反应的HIV-1整合酶抑制剂体外筛选方法,包括以下步骤:
(1)整合酶核心区蛋白的制备:
表达纯化野生型整合酶核心区蛋白,定量后稀释为3600nmol/L,分装保存待用。
(2)去整合DNA底物的制备:
将合成的寡核苷酸链1、2、3、4分别按照等摩尔浓度比例混合,震荡混匀后用铝箔纸完全封闭避光,置于95℃下孵育5分钟变性,缓慢冷却至室温退火,稀释为750nmol/L,分装避光保存待用;所述寡核苷酸序列如下:
寡核苷酸链1:5’-CCTCGAAGTCGACCTGCAGCCCAAGCTTGCGTTGCTGAACGAGG-3’
寡核苷酸链2:5’-ATGTGGAAAATCTCTAGCAGGCTGCAGGTCGAC-3’
寡核苷酸链3:5’-ACTGCTAGAGGATTTTCCACAT-3’
寡核苷酸链4:5’-CAGCAACGCAAGCTTG-3’;
(3)待测化合物样品的制备:
室温下将待测化合物样品用二甲亚砜配制成不同浓度的溶液,充分振荡溶解后备用;
(4)待测化合物样品的筛选:
反应体系为50μl/微孔,加入去离子水40μl。微孔板设阴性对照3孔,每孔分别加入2μl二甲亚砜,其他孔中每孔分别加入2μl不同浓度的待测化合物样品,设阳性对照3孔,加入的5μl蛋白质样品为高温变性后的整合酶核心区蛋白,之后所有孔均分别加入5μl整合酶核心区蛋白,振荡器充分混匀后,在25℃下孵育10~30分钟,加入去整合DNA底物3μl,振荡器充分混匀后,在37℃下孵育30分钟,用荧光分析仪检测报告基团信号,
按照以下公式计算待测样品的抑制率:
计算待测样品的抑制率。
2.根据权利要求1所述一种针对整合酶核心区去整合反应的HIV-1整合酶抑制剂体外筛选方法,其特征在于:所述DNA底物为使用了由荧光基团和淬灭基团标记的DNA底物,DNA底物由寡核苷酸链寡核苷酸链1、2、3、4混合、变性、退火后制备而成,寡核苷酸链序列为:
1:5’-CCTCGAAGTCGACCTGCAGCCCAAGCTTGCGTTGCTGAACGAGG-3’中5’端标记5-羧基荧光素,3’端标记4-(4’-二甲基对氨基偶氮苯)苯甲酸;
2:5’-ATGTGGAAAATCTCTAGCAGGCTGCAGGTCGAC-3’;
3:5’-ACTGCTAGAGGATTTTCCACAT-3’;
4:5’-CAGCAACGCAAGCTTG-3’。
3.根据权利要求1所述一种针对整合酶核心区去整合反应的HIV-1整合酶抑制剂体外筛选方法,其特征在于:所述整合酶核心区蛋白的制备,采用基于磁珠吸附DNA技术结合ELISA的液相微孔板方法中所用的制备方法。
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