[发明专利]DNA分析中使用二维码进行基因数据交换的方法及装置有效

专利信息
申请号: 201210107309.1 申请日: 2012-04-12
公开(公告)号: CN102663269A 公开(公告)日: 2012-09-12
发明(设计)人: 霍永学;戚文敏;李锋 申请(专利权)人: 北京海华鑫安生物信息技术有限责任公司
主分类号: G06F19/20 分类号: G06F19/20;G06K19/06
代理公司: 北京三友知识产权代理有限公司 11127 代理人: 戴云霓
地址: 100070 北京*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: dna 分析 使用 二维码 进行 基因 数据 交换 方法 装置
【说明书】:

技术领域

发明涉及二维码数据处理领域,具体地涉及一种DNA分析中使用二维码进行基因数据交换的方法及装置。

背景技术

短串联重复序列(short tandem repeat,STR)又称微卫星DNA(micro satellite DNA),是一类广泛存在于人类基因组中的DNA多态性基因座。它由2~6碱基对构成核心序列,呈串联重复排列。通常同一位点上以核心重复单元的重复数表示该基因座的等位基因型。STR位点因其基因片段短、扩增效率高、判型准确等特点。已广泛应用于法医学个体识别和亲子鉴定等领域。

是一款全球范围被广泛应用于众多DNA实验室的基因分析软件,其基本功能是基于STR试剂盒进行STR分子标记位点的扩增、测序,并进行基因型分型,在此基础上提供多种应用分析模块。

所述的STR基因分型信息是指,在一个试剂盒集成的多个STR标记位点上,单个样本在各位点的等位基因信息的集合。

例如,基因数据为:

abc-2011-003.fsa#DYS001<9>;DYS002<10,11>;DYS003<8.5,10>。其含义是:原始测序数据文件名称为abc-2011-003.fsa的样品,其DYS001基因座等位基因型为9(纯合);DYS002基因座上等位基因型为10,11;DYS003基因座上等位基因型为8.5,10。

软件详请参见其官方网站(英文):http://www.softgenetics.com/GeneMarker.html

在现有技术中,进行基因数据交换是采用测序仪电泳方式测定基因的序列,测序产生的荧光信号转化为电信号并以峰图的形式显示并储存,可通过峰图判定一个STR基因座上的等位基因分型,并通过人为抄录、CODIS(Combined DNA Index System,DNA联合索引系统)文件、用户定制文件等方法记录基因数据。发明人在实现本发明的过程中发现,传统的数据交换基于CODIS格式文件或人为抄录方式,需要耗费很多人力资源,效率较低,易出错。

发明内容

本发明的目的在于提供一种DNA分析中使用二维码进行基因数据交换的方法及装置,利用二维码等技术来替换以往的CODIS文件方法,以改善工作效率、提高安全性和实施标准化管理。

一方面,本发明实施例提供了一种DNA分析中使用二维码进行基因数据交换的方法,所述方法包括:将基因数据转换为二维码图像;将所述基因数据对应的峰图与所述二维码图像一起输出。

另一方面,本发明实施例提供了一种DNA分析中使用二维码进行基因数据交换的装置,所述装置包括:生成单元,用于将基因数据转换为二维码图像;输出单元,用于将所述基因数据对应的峰图与所述二维码图像一起输出。

本发明实施例的上述技术方案的有益效果在于:相对于传统的数据交换基于CODIS格式文件或人为抄录方式,需要耗费很少人力资源,效率较高,且不容易出错。

附图说明

为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图做一简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。

图1为本发明实施例的一种DNA分析中使用二维码进行基因数据交换的方法的整体流程图;

图2为本发明实施例的二维码输出过程的流程图;

图3为本发明实施例的由基因数据生成的二维码图像;

图4为本发明实施例的将大量基因型数据压缩后再转成二维码所得到的二维码图像;

图5为本发明实施例的在打印基因型数据峰图时,将二维码图像打印于峰图边上的示意图;

图6为本发明实施例的二维码采集过程的流程图;

图7为本发明实施例的从显示设备/纸/程序接口获取二维码时,扫描的二维码图像;

图8为本发明实施例的一种DNA分析中使用二维码进行基因数据交换的装置的功能框图;

图9为本发明实施例的一种DNA分析中使用二维码进行基因数据交换的装置的具体功能框图。

具体实施方式

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