[发明专利]HLA-F基因突变检测特异性引物和液相芯片

说明书

技术领域

本发明属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种HLA-F基因突变检测特异性引物和液相芯片。

背景技术

人类白细胞抗原(human leukucyte antigen，HLA)系统，是目前已知人类最复杂的显性遗传多态系统，由主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex，MHC)基因所编码，MHC包括I类与II类分子。MHC-I类分子分为两类：一类是多态性显性的经典MHC-I类分子(MHC-Ia)，包括HLA-A、-B、-C，它们在免疫应答中起重要作用；另一类为非经典MHC-I类分子，包括HLA-E，-F，-G，其在组织中分布有所不同。20世纪90年代初，位于6p21.3区域的人类第3个MHC-Ib分子HLA-5.4被命名为HLA-F，HLA-F是目前被发现的具有生物活性的MHC-Ib类分子，2009年一项在台湾人群中开展的SNP位点的全基因组关联分析揭示，HLA-F基因多态性与鼻咽癌易感性有关，HLA-F蛋白编码基因的多态性已成为了医学界研究热点。

本发明目标检测的HLA-F基因突变位点，如表所示：

SEQ ID NO.25(注：方框内的碱基为目标检测突变位点)  突变位点：T145C

TCTCCTGTTCCCAGCACCTGGACAGGGCTCTGCATACAAGGGGGTTCCCGATCTCAAGTCAGGCTCTGAGTCCATCCAGCTTCCCAAAATCCATGTTGACACTGACGTTTCCTCCCACCACTGAGTGACTCTGGATTTTGGCTTAGGGAAGAGATACCTCCAGGCCAAAACAGTGGGATCATATCTGGGGCTCATCCACCCCCAAACCATTGCTACCACATGACCTAGTCCCTCAGCCTCCAAAATGGGGCCTTGCCCTCCTGTCCCCTCCCTTGTTCCTGC。

SEQ ID NO.26  突变位点：C119T

CATCCATCCATCCATCCATCTATCCATCCATCCATCCATCCATCTACCCATCCACCCATCCACCCATCCACCTTTCTATCTCCTTGCAAGGTAGGTTCATCAACACTTTTACATTTATCCCCAGCAAAAATCTTTTTTTGGCTCACACCTGCCCTCCTTCATCCAGCCAACTGACATATTTGCTGAGGTCTTGCCACGTGCCGCACTGGGTGCTGAGCATTGGAGTCTAAACAGGAACAGACCCCTGGGATGCACTCCCGTCCTGGGATGCCCTTCACTGTCCCGTCCCTGGCTGTGAGACATCCTCATCTCCCTGAGGCTCTTGTTTCTGGTCACTGG。

HLA分型技术的发展经历了两个阶段：血清学分型阶段和DNA分型阶段。近年，随着PCR技术的成熟，HLA分型全面进入DNA分型阶段。与血清学相比较，DNA分型分辨率高，错误率少。目前国际标准的HLA分型技术包括以下三种：PCR-SSP(PCR with sequence-specific primers，序列特异引物PCR)，PCR-SSO(PCR with sequence-specific oligonucleotide probe hybridization，PCR寡核苷酸探针杂交)和PCR-SBT(PCR with sequencing-based typing，PCR产物直接测序分型)。PCR-SSP法是目前国际各医院临床实验室主要应用SSP法，该法实验过程快捷，准确率高，但是，该技术一次反应中仅可以检测一个位点的一种基因型，也就是说，需要同时使用两个独立的PCR体系分别检测是否存在野生型或突变型位点，并通过电泳观察是否有扩增条带以区分是否存在突变，而对于需要同时检测多种突变位点的情况，则操作复杂，耗时耗力，不能满足实际应用的需要。

发明内容

本发明的目的之一是提供HLA-F基因突变检测液相芯片，该液相芯片可用于单独或并行检测HLA-F基因两种常见基因型T145C和C119T的野生型和突变型。

实现上述目的技术方案如下：

一种HLA-F基因突变检测液相芯片，包括有：