[发明专利]染色体5p15区段SNP检测特异性引物和液相芯片

说明书

技术领域

本发明属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种染色体5p15区段SNP检测特异性引物和液相芯片。

背景技术

TERT-CLPTM1L基因区域位于染色体5p15.33区段，TERT-CLPTM1L基因多态性已被报道与多种肿瘤的发生风险相关。该区域存在两个已知的基因，端粒酶反转录酶(telomerase reverse transcriptase，TERT)和唇腭裂跨膜1样蛋白(cleft lip and palate transmembrane 1 like，CLPTM1L)基因。鉴于这两个基因的生化、生理功能和肿瘤病理学意义，这一基因区域是生物学证据非常充分的鼻咽癌易感基因候选位点，本发明将对与鼻咽癌遗传易感性的目标SNP位点C101T、C107T、C105A和C150T进行分开和并行检测。

本发明目标检测的染色体5p15区段突变位点，如表所示：

  序专  染色体5p15区段位点突变的内容  简写  1  SEQ ID NO.41的第101位核苷酸，发生C→T突变  C101T  2  SEQ ID NO.42的第107位核苷酸，发生C→T突变  C107T  3  SEQ ID NO.43的第105位核苷酸，发生C→A突变  C105A  4  SEQ ID NO.44的第150位核苷酸，发生C→T突变  C150T

SEQ ID NO.41                  C101T

CTACGCACAGACGGCACTCACGAGGTGTGGAGGGCCGAGCTGCCACGTCTATGCATAGTGGGCAGAAAA

CAAGGTCTGCTATCCAGACAACTTCAGAGTCATCATGGTGTGAAGCAGCTTTCTGGCTGGTAAGTTTA

TCAAGAGTCTACGACAACTTTGGAGAGCAAAGCTCTTCTATTTATTAATCAGTGTAACTGCTGCCCACG

GGGTCAAGTCAGTGAGAGCACTGGAGCACCCTG。

SEQ  ID NO.42                                C107T

GCTGCTCCTTGTCGCCTGAGGAGTAGAGGAAGTGCTTGGTCTCGGCGTACACCGGGGGACAAGGCGTGT

CCCAGGGACGTGGTGGCCGCGATGTGGATGGGGGGCCGCGTGGTGCTGGCGGCCCACGGATGGGTGGG

AGTGGCGCGTGCCAGAGAGCGCACCCTCCAAAGAGGTGGCTTCTTCGGCGGGTCTGGCAGGTGACACCA

CACAGAAACCACGG。

SEQ  ID NO.43                                C105A