[发明专利]采用多维矩阵参照基本结构单元进行药物构架化合物设计的方法及其应用有效
申请号: | 201210100889.1 | 申请日: | 2012-04-09 |
公开(公告)号: | CN102663250A | 公开(公告)日: | 2012-09-12 |
发明(设计)人: | 闫京波;张志强 | 申请(专利权)人: | 闫京波;张志强 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 北京中创阳光知识产权代理有限责任公司 11003 | 代理人: | 尹振启 |
地址: | 北京市海淀区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 采用 多维 矩阵 参照 基本 结构 单元 进行 药物 构架 化合物 设计 方法 及其 应用 | ||
1.一种药物构架化合物结构的设计方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
(1)选定化合物基本结构单元类型,主要是以环状化合物为设定目标,优选为杂环或非杂环的饱和或不饱和的环状化合物;
(2)将选定的化合物基本结构单元结构类型定义为固定因素,分别以大写字母A,B,C,D...Y或Z加以表示;
(3)参照经验型数据,选择影响化合物的可变因素及其变量,所述的可变因素分别以小写字母a,b,c,d...y或z加以表示,所述a的变量选自a1、a2、a3...an,所述b的变量选自b1、b2、b3...bn,所述c的变量选自c1、c2、c3...cn,所述d的变量选自d1,d2,d3...dn,所述y的变量选自y1、y2、y3...yn,所述z的变量选自z1、z2、z3...zn,其中n为自然数,优选所述化合物选自“像药型”化合物、候选药物、药物的任一种或其组合;
(4)采用多维矩阵排列对比分析固定因素的相应变量与可变因素的相应变量,获得优化的化合物结构类型,完成药物构架化合物结构的结构设计与优化。
2.根据权利要求1所述的设计方法,其特征在于,所述方法还包括:
(5)结合市场信息,对优化出的代表性新型药物构架化合物类型进行对比和评估,确定具备价值的新型药物构架化合物结构。
3.根据权利要求1或2所述的设计方法,所述方法还进一步包括如下任一或全部步骤:
(6)在确定固定因素后,分别选择A,B,C,D...Y或Z的变量,所述A的变量选自A1、A2、A3...An,所述B的变量选自B1、B2、B3...Bn,所述C的变量选自C1、C2、C3...Cn,所述D的变量选自D1,D2,D3...Dn,所述Y的变量选自Y1、Y2、Y3...Yn,所述Z的变量选自Z1、Z2、Z3...Zn,其中n为自然数;和/或
(7)采用多维矩阵排列、组合和聚类分析步骤(6)中所述的固定因素A,B,C,D...Y或Z的相应变量与可变因素a,b,c,d...y或z的相应变量,再参照结构区域和经验性数据的结构对比结果,优选出具有代表性的化合物结构类型A’、B’、C’、D’...Y’或Z’;和/或
(8)对步骤(7)优选出的具有代表性的化合物结构类型A’、B’、C’、D’...Y’或Z’进行结构分析与结构确认,确定其可选择的变量,其中,代表性的化合物结构类型A’的变量选自A’1、A’2、A’3...A’n,代表性的化合物结构类型B’的变量选自B’1、B’2、B’3...B’n,代表性的化合物结构类型C’的变量选自C’1、C’2、C’3...C’n,代表性的化合物结构类型D’的变量选自D’1,D’2,D’3...D’n……,代表性的化合物结构类型Y’的变量选自Y’1、Y’2、Y’3...Y’n,代表性的化合物结构类型Z’的变量选自Z’1、Z’2、Z’3...Z’n,n为自然数;和/或
(9)参照经验型数据,选择代表性化合物结构类型的可变因素及其变量,所述的可变因素分别以小写字母a’,b’,c’,d’...y’或z’加以表示,其中,可变因素a’的变量选自a’1、a’2、a’3...a’n,可变因素b’的变量选自b’1、b’2、b’3...b’n,可变因素c’的变量选自c’1、c’2、c’3...c’n,可变因素d’的变量选自d’1,d’2,d’3...d’n……,可变因素y’的变量选自y’1、y’2、y’3...y’n,可变因素z’的变量选自z’1、z’2、z’3...z’n,n为自然数;
(10)采用多维矩阵排列、组合和聚类分析步骤(8)中所述的代表性化合物结构类型A’、B’、C’、D’...Y’或Z’的相应变量与步骤(9)中所述的可变因素a’,b’,c’,d’...y’或z’的相应变量,再参照结构区域和经验性数据的结构对比结果,优选出具有代表性的化合物结构类型A’B’、B’C’、C’D’...Y’Z’;和/或
(11)根据需要,参照步骤(8)-(10)所述的方法,采用多维矩阵排列、组合和聚类分析优选出的具有代表性的化合物结构类型A’B’、B’C’、C’D’...Y’Z’的相应变量与可变因素a’b’、b’c’、c’d’...y’z’的相应变量,再参照结构区域和经验性数据的结构对比结果,优选出具有代表性的化合物结构类型A”B”C”、B”C”D”...X”Y”Z”;和/或
(12)根据药物构架化合物的设计需要,采用多维矩阵重复进行上述步骤中的部分或全部步骤来进行结构组合、结构分析和结构确认,直至获得所需性能的药物构架化合物结构类型的结构设计与优化。
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