[发明专利]一种从动物粪便中提取高分子量基因组的方法无效
申请号: | 201210062436.4 | 申请日: | 2012-03-12 |
公开(公告)号: | CN102586234A | 公开(公告)日: | 2012-07-18 |
发明(设计)人: | 许波;杨富亚;黄遵锡;杨云娟;李俊俊;唐湘华 | 申请(专利权)人: | 云南师范大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 昆明正原专利代理有限责任公司 53100 | 代理人: | 金耀生 |
地址: | 6500*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 动物 粪便 提取 分子量 基因组 方法 | ||
1.一种从动物粪便中提取高分子量基因组的方法,其特征在于按以下步骤进行:
(1)样品处理:用无菌PBS缓冲液溶解收集的动物粪便样品,彻底混匀后先低速离心去除大的食物残渣,然后依次用孔径为100μm、70μm、40μm的灭菌细胞过滤器进行过滤,并用PBS缓冲液对截留在滤网上的杂质进行多次冲洗;滤液置于离心机中离心,收集菌体;菌体依次用PBS缓冲液和TE缓冲液洗涤、离心收集菌体,用TE缓冲液悬浮菌体;
(2)菌体细胞裂解: 向菌体悬浮液中加入高浓度的溶菌酶至终浓度15mg/ml,轻柔混匀后37℃水浴1h;加入消色肽酶至终浓度3mg/ml,轻柔混匀后37℃水浴30min;加入蛋白酶K至终浓度2mg/ml,轻柔混匀后55℃水浴5min;加入浓度为10%的SDS,轻柔混匀后55℃水浴1h;
(3)抽提DNA:在上述处理后的细胞裂解液中加入等体积的酚/氯仿/异戊醇混合液,轻柔混匀后离心收集上清液;加入等体积的氯仿/异戊醇混合液,轻柔混匀后离心收集上清液;加入1倍体积异丙醇、1/10体积醋酸钠,轻柔混匀后室温沉淀30min以上;离心收集沉淀,用浓度为70%的乙醇洗涤沉淀,离心后收集沉淀;沉淀置于室温或真空干燥后,用TE或无菌去离子水溶解,并用RNA酶37℃水浴30min消解去除RNA,即为基因组DNA提取液。
2.根据权利要求1所述的从动物粪便中提取高分子量基因组的方法,其特征在于所述PBS缓冲液为:137 mmol/L NaCl,2.7 mmol/L KCl,10 mmol/L Na2HPO4,2 mmol/L KH2PO4,pH 7.4。
3.根据权利要求1所述的从动物粪便中提取高分子量基因组的方法,其特征在于所述TE缓冲液为:10 mmol/L Tris-HCl(pH 8.0),1 mmol/L EDTA(pH 8.0)。
4.根据权利要求1所述的从动物粪便中提取高分子量基因组的方法,其特征在于所述酚/氯仿/异戊醇混合液的体积比为25:24:1。
5.根据权利要求1所述的从动物粪便中提取高分子量基因组的方法,其特征在于所述氯仿/异戊醇混合液的体积比为24:1。
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