[发明专利]一种检测ATP适配子和ATP的方法有效

专利信息
申请号: 201210040118.8 申请日: 2012-02-22
公开(公告)号: CN102559915A 公开(公告)日: 2012-07-11
发明(设计)人: 刘霞;王振新;李小梅;刘殿骏 申请(专利权)人: 中国科学院长春应用化学研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;G01N21/64
代理公司: 长春菁华专利商标代理事务所 22210 代理人: 陶尊新
地址: 130022 吉林*** 国省代码: 吉林;22
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 atp 配子 方法
【说明书】:

技术领域

发明属于生物技术领域,具体涉及一种检测ATP适配子和ATP的方法。

背景技术

三磷酸腺苷(Adenosine triphosphate,ATP)被广泛认为是细胞内的能量货币,在大多数酶反应中起着重要作用,ATP的浓度和消耗率与许多疾病的发生密切相关,例如:缺氧、低血糖、缺血和帕金森氏病等。传统测ATP的方法包括高压液相法、放射性同位素法等,其中高压液相法繁琐且昂贵,检测时间需要30分钟以上,且不能直接测定ATP的含量,灵敏度仅为毫摩尔级;放射性同位素方法的灵敏度高,但污染大,需要样品的防护和废弃物处理过程,不适合大量使用。近年来,核酸适配子作为核酸探针的一种,具有很强的亲和力和选择性,逐渐取代传统的抗体,被广泛应用于生化分析中。已有文献针对核酸适配子与ATP的特异性识别作用报道了几种检测ATP的方法,如金纳米比色法(先进材料,Adv.Mater.2007,19(22),3943-3946),荧光计法(德国应用化学,Angew.Chem.Int.Ed.,2004,43(36),4777-4780;纳米快报,Nano Lett.,2006,6(3),371-375),电化学检测法(美国化学学会杂志,J.Am.Chem.Soc.,2007,129(5),1042-1043),但这些方法操作繁杂,样品消耗量大,难于微型化。

生物芯片是目前基因组学,蛋白质组学研究的重要工具,具有高通量,并对检测样品消耗量少等优点(基因生物学,Genome Biol.2001,2,research0004.1~0004.13),由于适配子分子与靶分子的结合具有高灵敏度、高特异性的特点,因此将核酸适配子、ATP的特异性识别与生物芯片结合在一起的技术还未见报道。

发明内容

本发明的目的是为了解决现有检测ATP的方法操作繁杂,样品消耗量大,难于微型化及灵敏度仅为毫摩尔级的缺点,而提供一种检测ATP适配子和ATP的方法。

一种检测ATP适配子和ATP的方法,包括以下步骤:

步骤一:将ATP适配子与点样液混合得到ATP适配子溶液,在基片上进行点样,得到ATP适配子生物芯片;

步骤二:将步骤一得到的ATP适配子生物芯片上的ATP适配子与CY5标记的DNA互补链进行杂交反应,得到荧光标记的ATP适配子生物芯片;

步骤三:将步骤二得到的荧光标记的ATP适配子生物芯片与ATP样品溶液反应,得到ATP与ATP适配子相互作用后的生物芯片;

步骤四:将步骤三得到的ATP与ATP适配子相互作用后的生物芯片放入微阵列扫描仪中进行检测,得到ATP适配子生物芯片的荧光检测信号。

所述的步骤一中ATP适配子的浓度为0.1μM~20μM。

所述的步骤一中的ATP适配子为3’-NH2修饰的DNA适配子。

所述的步骤二中CY5标记的DNA互补链的浓度为0.08μM~0.1μM。

所述的步骤二中ATP适配子生物芯片上的ATP适配子与CY5标记的DNA互补链是在温度为25℃~30℃,相对湿度为80%~90%的恒温恒湿箱中进行杂交反应。

所述的步骤三中ATP样品溶液是由ATP反应溶液和ATP混合得到的,ATP反应溶液的组成为:含有21mmol/L氯化钾的15mmol/L~25mmol/L氨基丁三醇缓冲溶液;所述的ATP样品溶液的pH值为7.6。

所述的步骤三中反应温度为25℃~30℃,优选为25℃。

发明原理:本发明一种检测ATP适配子和ATP的方法,该方法采用DNA微阵列技术,固定ATP适配子,以带有荧光染料CY5的DNA互补链为标记物,通过杂交反应标记生物芯片,再利用ATP与ATP适配子的特异性识别作用,结合微阵列荧光扫描仪,获得生物芯片上荧光染料的荧光信号,可实现ATP适配子和ATP的同时检测。

有益效果:本发明提供的一种检测ATP适配子和ATP的方法,方法简便、样品消耗少,时间消耗短,具有通用性,灵敏度可达到1nM,检测线性范围宽,可同时检测ATP适配子和ATP,实验结果表明:利用本方法所获得的ATP适配子的检测范围为:0μM~10μM,当其浓度为10μM时,荧光信号趋于饱和;ATP检测限为:1nM,线性范围为:3个数量级。

附图说明

图1是本发明所述的检测ATP适配子和ATP的方法过程示意图,其中a为ATP适配子,b为多T链,c为CY5标记的DNA互补链,d为ATP;

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