[发明专利]与玉米抗丝黑穗病基因连锁的SNP位点、基于该位点的分子标记LSdCAP3及其应用有效
| 申请号： | 201210031213.1 | 申请日： | 2012-02-13 |
| 公开（公告）号： | CN102559668A | 公开（公告）日： | 2012-07-11 |
| 发明（设计）人： | 王振华;李新海;邸宏;刘显君;翁建锋;张林;曾兴;阚帅帅;于滔 | 申请（专利权）人： | 东北农业大学 |
| 主分类号： | C12N15/11 | 分类号： | C12N15/11;C12N15/10;C12Q1/68 |
| 代理公司： | 北京科龙寰宇知识产权代理有限责任公司 11139 | 代理人： | 孙皓晨;费碧华 |
| 地址： | 150030 黑龙江*** | 国省代码： | 黑龙江;23 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 玉米 黑穗病 基因 连锁 snp 基于 分子 标记 lsdcap3 及其 应用 | ||
1.一种与玉米抗丝黑穗病基因连锁的SNP位点，命名为SNP-3，其特征在于，所述的SNP位点位于如SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列中，所述的SNP位点为T51G，其中核苷酸位置的编号基于SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列。
2.一种基于SNP位点开发dCAPS分子标记的方法，其特征在于以含有与玉米抗丝黑穗病显著相关的SNP-3位点的核苷酸序列为基础序列，设计dCAPS引物对，以玉米总DNA为模板进行PCR扩增，使SNP-3位点有效的转化为dCAPs标记；其中所述的含有与玉米抗丝黑穗病显著相关的SNP-3位点的核苷酸序列如SEQ IDNO.4所示。
3.如权利要求2所述的方法，其特征在于，所述的dCAPS引物对序列如下所示：
LSCAP3上游(F)GGCTGCGCCGTGAGATACT
下游(R)GCTCTCGATCTGTCCTTGTCACCA。
4.按照权利要求2或3所述的方法得到的与玉米抗丝黑穗病基因紧密连锁的dCAPS分子标记，命名为LSdCAP3，其特征在于，所述的分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
5.获得权利要求4所述的与玉米抗丝黑穗病基因紧密连锁的dCAPS分子标记的引物对。
6.如权利要求5所述的引物对，其特征在于，所述的dCAPS引物对序列如下所示：
LSCAP3上游(F)GGCTGCGCCGTGAGATACT
下游(R)GCTCTCGATCTGTCCTTGTCACCA。
7.权利要求1所述的与玉米抗丝黑穗病基因连锁的SNP基因位点在玉米抗丝黑穗病分子标记辅助育种中的用途。
8.权利要求4所述的与玉米抗丝黑穗病基因紧密连锁的dCAPS分子标记在玉米抗丝黑穗病分子标记辅助育种中的用途。
9.权利要求5或6所述的引物对在玉米抗丝黑穗病分子标记辅助育种中的用途。
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