[发明专利]显微镜载玻片坐标系对齐

权利要求书

1.一种根据第一成像站点上感兴趣对象的坐标在第二成像站点上重新定位感兴趣对象的方法，该方法包含：

获取包括第一成像站点上的标本的参考图像和第二成像站点上的标本的第二图像的第一对图像；

识别出现在参考图像和第二图像两者中的细胞群；

从获取参考图像的载物台坐标中确定第一成像站点上的细胞群的载物台坐标；

从获取第二图像的载物台坐标中确定第二成像站点上的细胞群的载物台坐标；以及

计算将第一成像站点的载物台坐标转换成第二成像站点的载物台坐标的仿射变换。

2.如权利要求1所述的方法，进一步包含：

获取包括在第一成像站点上获得的参考图像和在第二成像站点上获得的第二图像的第二对图像；

对于第二对图像，识别出现在参考图像和第二图像两者中的细胞群；

确定第一成像站点和第二成像站点上与第二对图像相关联的细胞群的载物台坐标；以及

根据第一和第二对图像计算仿射变换。

3.如权利要求1所述的方法，其中获取第一对图像包括从在第一成像站点上在标本的扫描期间获得的多个参考图像候选者中选择参考图像。

4.如权利要求3所述的方法，进一步包含：

对多个参考图像候选者的每一个指定适用性得分；以及

选择适用性得分最高的参考图像候选者作为参考图像。

5.如权利要求4所述的方法，其中指定适用性得分包括指定与从参考图像内取得的预定大小的图像包括独特可识别细胞的概率相对应的得分。

6.如权利要求4所述的方法，其中指定适用性得分包括：

将每个参考图像候选者划分成多个图像区；

识别每个图像区中缺乏细胞的区的数量；以及

根据识别的数量指定适用性得分。

7.如权利要求3所述的方法，进一步包含在第一成像站点上从在扫描期间获得的标本的扫描区内的多个预定区域的每一个中获取多个参考图像候选者。

8.如权利要求7所述的方法，进一步包含识别多个预定区域，其包括：

将标本的扫描区划分成等楔形块；以及

从每个楔形块中除去扫描区的中心部分。

9.如权利要求1所述的方法，进一步包含如果第二图像不包含在参考图像中识别的细胞群，则在第二成像站点上在第二图像附近的地点上获取一个或多个附加图像。

10.如权利要求1所述的方法，其中识别出现在参考图像和第二图像两者中的细胞群进一步包含：

从第二图像中识别细胞中心点的排列；以及

将来自第二图像的细胞中心点的排列与参考图像中的细胞中心点的排列相比较。

11.如权利要求10所述的方法，进一步包含：

从第二图像中识别深处背景点的排列；以及

将来自第二图像的深处背景点的排列与参考图像中的深处背景点的排列相比较。

12.如权利要求11所述的方法，其中将来自第二图像的细胞中心点和深处背景点的排列与参考图像相比较包含：

以相对于参考图像的两个或更多个偏移量布置细胞中心点和深处背景点的排列；

为两个或更多个偏移量的每一个计算匹配得分；以及

根据匹配得分为偏移量确定匹配。

13.如权利要求12所述的方法，其中为每个偏移量计算匹配得分包含：

计算参考图像的距离变换；

为细胞中心点的排列计算距离变换值的第一和值；

为深处背景点的排列计算距离变换值的第二和值；以及

从第一和值中减去第二和值以计算匹配得分。