[发明专利]非侵入性产前亲子鉴定方法

权利要求书

1.一种体外确定疑父是否为怀孕母亲所孕育胎儿的生父的方法，该方法包括：

获得源于疑父的遗传物质在多个多态性位点的基因型测量结果，其中，该多态性位点包括单核苷酸多态性(SNPs)；

获得源于怀孕母亲的血样中的DNA混合样品在多个多态性位点的基因型测量结果，该DNA混合样品中含有胎儿DNA及母体DNA，和其中所述基因型测量结果来自常染色体；

使用由疑父的DNA得到的基因型测量结果、由怀孕母亲得到的基因型测量结果，以及DNA混合样本的基因型测量结果，在计算机上，确定该疑父是该胎儿生父的概率；并且

利用确定的该疑父是该胎儿生父的概率，确认该疑父是否为该胎儿的生父。

2.根据权利要求1所述的方法，还包括对源于基本由怀孕母亲的遗传物质构成的样本在多个多态性位点做基因型测定。

3.根据权利要求1所述的方法，其中，该DNA混合样品包括(i)源于怀孕母亲血样的血浆成分中自由浮动的DNA，(ii)母亲全血，或者(iii)母亲血液中包含有核细胞的部分。

4.根据权利要求3所述的方法，其中，该母体血液中包含有核细胞的部分已经胎儿源细胞富集。

5.根据权利要求2所述的方法，其中，该确定方法包括：

计算疑父的检验统计量，其中疑父的检验统计量显示疑父和胎儿一定程度的遗传相似性，并且其中疑父检验统计量是基于疑父的遗传物质的基因型测量结果，基本由怀孕母亲的遗传物质构成的样本的基因型测量结果，DNA混合样品基因型测量结果；

计算多个与胎儿遗传上无亲属关系的个体的检验统计量，其中每一个无关个体的检验统计量显示该无关个体与胎儿的基因相似性水平，并且其中该无关个体检验统计量基于无关个体的遗传物质基因型测量结果，基本与由怀孕母亲的遗传物质构成的样本的基因型测量结果，和DNA混合样品基因型测量结果；

计算疑父检验统计量是多个无关个体检验统计量分布一部分的概率，并且

使用疑父检验统计量是多个无关个体检验统计量分布一部分的概率，来确定该疑父是否为该胎儿生父的概率。

6.根据权利要求5所述的方法，其中，确认一个疑父是否为所述胎儿的生父包括：

当所述疑父是所述胎儿生父的概率高于一个阈值上限时，排除所述疑父与所述胎儿无亲属关系的假设，确认该疑父是所述胎儿生父；

当所述疑父是所述胎儿生父的概率低于一个阈值下限时，不排除所述疑父与所述胎儿无亲属关系的假设，确认该疑父不是所述胎儿的生父；

当该可能性在所述阈值下限和阈值上限之间，或足够确认可能性不确定时，不能确认该疑父是否为所述胎儿生父。

7.根据权利要求2所述的方法，其中，确定所述疑父是所述胎儿生父的概率包括：

获取多个多态性位点的每一个位点的等位基因的群体频率；

创建一个DNA混合样品中胎儿DNA相对于总DNA的可能比的分区，该分区的范围是胎儿DNA相对于总DNA的比的下限到上限；

根据DNA混合样品基因型测量结果与DNA混合额样品的预期基因型测量结果的比较，对分区中胎儿DNA相对于总DNA的可能比，计算：(i)该疑父是该婴儿生父的一个概率，以及(ii)该疑父不是该婴儿生父的一个概率；

针对该分区中的每一个胎儿DNA相对于总DNA的可能比，通过结合计算的所述疑父不是所述胎儿的生父的概率来确定该疑父是该婴儿生父的概率；

针对该分区中的每一个胎儿DNA相对于总DNA的可能比，通过结合计算的该疑父不是该婴儿生父的概率，确定出所述疑父不是所述胎儿生父的概率。