[发明专利]结直肠癌的外遗传标记以及使用它们的诊断方法

权利要求书

1.一种在个体中筛查大肠瘤开始或开始的倾向或监测肿瘤进展的方法，所述方法包括在来自所述个体的生物学样品中评估DNA区域的甲基化状态，所述DNA区域选自：

(i)由Hg19坐标的任何一个或多个和转录起始位点上游2kb限定的区域：

(ii)以下任何一个或多个的基因区域，包括上游2kb：

其中相对于对照水平而言组(i)和/或(ii)的DNA区域的较高甲基化水平指示有大肠瘤或大肠瘤形成状态开始的倾向。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述一个或多个DNA区域选自：

(i)由Hg19坐标的任何一个或多个和转录起始位点上游2kb限定的区域：

(ii)以下任何一个或多个的基因区域，包括上游2kb：

3.一种在个体中筛查大肠瘤开始或开始的倾向或监测肿瘤进展的方法，所述方法包括在来自所述个体的生物学样品中评估一个或多个DNA区域的甲基化状态，所述DNA区域选自由Hg19坐标限定的DNA区域：

当相对于对照水平而言所述DNA区域的甲基化水平较高时，指示有大肠瘤形成或大肠瘤状态开始的倾向。

4.根据权利要求3所述的方法，其中所述DNA区域选自Hg19坐标限定的DNA区域：

5.根据权利要求4所述的方法，其中所述DNA区域选自Hg19坐标限定的DNA区域：

6.根据权利要求1-5中任一项所述的方法，其中所述瘤细胞是腺瘤或腺癌。

7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法，其中所述对照水平是非瘤水平。

8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述瘤形成是结直肠瘤形成。

9.根据权利要求1-8中任一项所述的方法，其中所述生物学样品是粪便样品、灌肠洗涤、手术切除、组织活组织检查样品或血液样品。

10.根据权利要求1-9中任一项所述的方法，其中通过筛查针对基因组DNA的改变评估所述表达水平。

11.根据权利要求10所述的方法，其中所述针对基因组DNA的改变是针对DNA甲基化的变化。

12.根据权利要求11所述的方法，所述方法包括在来自所述个体的生物学样品中评估一个或多个胞嘧啶残基的甲基化，所述胞嘧啶残基选自：

或对侧DNA链上位置n+1处的相应胞嘧啶，其中相对于对照样品中相应残基的甲基化水平而言，一个或多个所述残基的较高甲基化水平指示有大肠瘤或瘤形成状态开始的倾向。