[发明专利]用于预测GBM患者的存活的替莫唑胺对TOP2A的抑制

说明书

发明领域

本发明涉及用于预测胶质母细胞瘤患者的存活率的替莫唑胺对拓扑异构酶IIα(TOP2A)的抑制。

更具体地，本发明证明了TOP2A转录物水平决定胶质母细胞瘤对替莫唑胺疗法的化学敏感性，从而解释非常高水平的TOP2A转录物是GBM患者接受替莫唑胺化学疗法的良好预后指标。

发明背景

胶质母细胞瘤(IV级星形细胞瘤)是最恶性和最常见的原发性成人脑癌(Furnari等人,2007)。此类肿瘤的高度异质和浸润性质使得全切除实际上是不可能的，因此尽管进行术后治疗方式，但中位存活期(median survival)仍然不佳。虽然单独的术后放射疗法提供微小的存活有利方面，放射疗法加上基于亚硝基脲的化学疗法产生了6%的一年存活率的增加(例如40%至46%)以及中位存活时间的2个月的增加的有限益处(Stewart,2002)。EORTC-NCIC试验的5年分析显示伴随和循环佐剂替莫唑胺(DNA烷化剂)至标准术后放射疗法的添加相对于单独的术后放射疗法改善了中位存活期和2年存活率(Stupp等人,2009)。利用替莫唑胺的2年的总存活率为27.2%，3年的总存活率为16.0%，4年的总存活率为12.1%，5年的总存活率为9.8%，与之相对地利用单独的放射疗法的相应存活率分别为10.9%、4.4%、3.0%和1.9%(Stupp等人,2009)。此后，中位存活期从12.1个月增加至14.6个月(Stupp等人,2009)。更重要地，发现MGMT启动子的甲基化是来自替莫唑胺化学疗法的效果和益处的最强预测指标(predictor)(Stupp等人,2009)。无进展生存期(progression-free survival)的分析显示了仅其肿瘤具有甲基化的MGMT启动子，利用替莫唑胺和放射疗法治疗的患者的有利方面。

这些发现表明存在可鉴定具有更好的对替莫唑胺化学疗法的反应的患者的亚类的特殊基因标记(gene signatures)。

在本发明中，进行前瞻性研究，在所述研究中利用标准选择标准/淘汰标准选择患者，将其经历统一治疗方案，所述方案包括肿瘤的最大安全切除术，随后进行结合伴随和循环佐剂替莫唑胺疗法的放射疗法。使患者的存活数据与肿瘤基因表达谱发生关联以鉴定其表达标记可预测存活率的基因。我们在此处报导了我们关于GBM中的高拓扑异构酶IIα(TOP2A)转录物对患者存活率的影响的观察。我们还通过功能性研究显示替莫唑胺在体外抑制TOP2A的活性并且神经胶质瘤细胞中TOP2A的沉默使得它们对替莫唑胺产生抗性。还进行了跨星形细胞瘤等级的TOP2A和拓扑异构酶的其它同种型的评估来阐明它们在神经胶质瘤中的作用。

发明目的

本发明的主要目的是提供预后标志TOP2A，其用于预测提供给胶质母细胞瘤患者的化学疗法治疗的类型。

本发明的另一个目的是提供测定人受试者的胶质母细胞瘤的预后的方法，其中所述方法包括测定获自人受试者的脑瘤组织细胞的测试样品中和已知的正常脑组织细胞的对照样品中基因TOP2A的表达水平，所述受试者经历手术并且准备接受与伴随和循环佐剂替莫唑胺疗法结合的放射疗法,其中与对照样品相比较，测试样品中更高水平的TOP2A表达表示从其获得所述测试样品的人受试者的胶质母细胞瘤的良好预后和更好的存活率。

发明概述

本发明提供了预后标记和测定人受试者的胶质母细胞瘤的预后的方法，其中所述方法包括测定获自人受试者的脑瘤组织细胞的测试样品中和已知的正常脑组织细胞的对照样品中基因TOP2A的表达水平，

所述受试者经历手术并且准备接受与伴随和循环佐剂替莫唑胺疗法结合的放射疗法，其中与对照样品相比较，测试样品中TOP2A的更高表达水平表示从其获得所述测试样品的人受试者的胶质母细胞瘤的良好预后和更好的存活率。

附图和表的概述

图1

A)TOP2A表达和GBM患者存活率.

针对TOP2A转录物水平计算102个GBM患者的Kaplan-Meier存活评价(Kaplan-Meier survival estimate)。单变量分析中的TOP2A阳性(log2比率≥9.25;n=34)和阴性(log2比率<9.25;n=68)组的存活曲线。TOP2A是阳性(绿线)的病例具有比为阴性的病例(蓝线)更好的存活率。

B)不同等级的星形细胞瘤中的TOP2A的转录物水平的散布图.