[发明专利]含有内部非核酸间隔子的单链RNAi试剂

权利要求书

1.单链RNA分子，其介导针对目标RNA的RNA干扰，其中所述单链RNA包含：

(a) 核酸部分，包含不是自我互补的第一核苷酸部分(N1)和第二核苷酸部分(N2)，其中所述核酸部分包含可以与所述目标RNA的目标位点碱基配对的至少8个核苷酸，并且其中所述核酸部分内的核苷酸总数为8-26个核苷酸；和

(i) 内部间隔子部分，其中所述间隔子部分包含至少一个第一非核苷酸间隔子部分(S1)，所述第一非核苷酸间隔子部分(S1)共价连接所述第一和第二核苷酸部分。

2.权利要求1的核苷酸，其包含下述结构：

5'  N1–S1–N2  3'

其中：

(a) N1含有一个核苷酸或一段连续的核苷酸；

(b) S1含有一个或多个共价连接N1和N2的非核苷酸间隔子；和

(c) N2含有一个核苷酸或一段连续的核苷酸。

3.权利要求1或2的分子，其中S1是脂族或芳族有机基团。

4.权利要求1-3中任一项的分子，其中S1是任选取代的C₁-C₁₂烷基链。

5.权利要求4的分子，其中所述烷基链任选地用胆固醇取代。

6.权利要求1-5中任一项的分子，其中S1选自C3烷基、C6烷基和聚乙二醇。

7.权利要求1-6中任一项的分子，其中N1是13至20个核苷酸长。

8.权利要求1-7中任一项的分子，其中所述核酸部分内的核苷酸总数为约19至约21个核苷酸。

9.权利要求1-8中任一项的分子，其中所述目标位点在所述目标RNA的非翻译区域内。

10.权利要求9的分子，其中所述可以与所述目标位点碱基配对的至少8个核苷酸是天然存在的内源miRNA核苷酸序列的种子序列的全部或部分。

11.权利要求10的分子，其中S1代替所述天然存在的内源miRNA核苷酸序列的1至4个内部核苷酸。

12.权利要求9-11中任一项的分子，其中所述分子的所述核酸部分与所述天然存在的内源miRNA核苷酸序列至少50%同源。

13.权利要求1-8中任一项的分子，其中所述目标位点在所述目标RNA的基因编码区域内。

14.权利要求1-13中任一项的分子，其中所述分子的所述核酸部分与所述目标位点至少90%互补。

15.权利要求1-14中任一项的分子，其中所述核酸部分包含可以与所述目标位点碱基配对的至少20个核苷酸。

16.权利要求1-15中任一项的分子，其中所述核酸部分进一步包含第三核苷酸部分(N3)，并且所述内部间隔子部分进一步包含第二非核苷酸间隔子部分(S2)。

17.权利要求1-16中任一项的分子，其中至少一个核苷酸具有修饰的糖。

18.权利要求1-17中任一项的分子，其中至少一个核苷酸具有修饰的核苷间键。

19.权利要求1-18中任一项的分子，其在5'-末端、3'-末端或5'-和3'-末端具有末端帽。

20.组合物，其包含权利要求1-19中任一项的单链RNA分子和药学上可接受的载体。

21.权利要求20的组合物，其进一步包含脂质体、水凝胶、环糊精、生物可降解的纳米胶囊、生物粘附性微球或蛋白性载体。

22.降低细胞中内源RNA目标基因的表达的方法，其包括施用权利要求20或权利要求21的组合物。