[发明专利]一种从单粒稻米胚乳中提取高质量基因组DNA的方法有效
申请号: | 201110434777.5 | 申请日: | 2011-12-22 |
公开(公告)号: | CN102433323A | 公开(公告)日: | 2012-05-02 |
发明(设计)人: | 赵庆勇;姚姝;陈涛;赵春芳;周丽慧;于新;张亚东;朱镇;赵凌;王才林 | 申请(专利权)人: | 江苏省农业科学院 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 张素卿 |
地址: | 210014*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 稻米 胚乳 提取 质量 基因组 dna 方法 | ||
1.一种从单粒稻米胚乳中提取高质量基因组DNA的方法,其特征在于包括以下步骤:
1) 去除稻壳、种皮、果皮、胚的单粒稻米,经牛皮纸包裹后,用研磨棒砸碎装入1.5 mL离心管;
2) 加入800 μL洗涤液于摇床上120 rpm振荡5 min去除多糖,4,000 rpm离心2 min,丢弃上清液后收集沉淀;
3) 在沉淀中加入600 μL DNA提取缓冲液,漩涡振荡使沉淀悬浮并上下颠倒混匀,而后置于65°C水浴45 min以裂解细胞;
4) 待上述混合物冷至室温后加入600 μL苯酚:氯仿:异戊醇体积比为25:24:1的苯酚-氯仿-异戊醇混合液,于摇床上120 rpm振荡5-10 min至乳白色,12,000 rpm离心5 min,定量吸取500 μL上清液至另一新离心管,再加入500 μL氯仿:异戊醇体积比为24:1的氯仿-异戊醇混合液,于摇床上120 rpm振荡5-10 min至乳白色,12,000 rpm离心5 min后,定量吸取400 μL上清液至另一新离心管,加入40 μL pH=5.2的5 M醋酸钾溶液和293 μL异丙醇混匀,于4°C放置2 h,12,000 rpm离心10 min,丢弃上清液,收集DNA沉淀,加入1 mL 体积比为70%的乙醇后轻弹管底使沉淀悬浮,于摇床上120 rpm振荡2 min,7,000 rpm离心3 min,丢弃上清液,室温下干燥沉淀,加入100 μL去离子水溶解沉淀,获得DNA粗提液;
5) 向DNA粗提液中加入核糖核酸酶A至终浓度0.1 mg/mL,37°C温浴30 min去除RNA,再加入氯仿:异戊醇体积比为24:1的氯仿-异戊醇混合液抽提并重复上述的沉淀、润洗、干燥、溶解步骤后,将沉淀用100 μL去离子水溶解,即获得DNA溶液。
2.根据权利要求1所述的一种从单粒稻米胚乳中提取高质量基因组DNA的方法,其特征在于:所述的洗涤液其成分包括:100mM pH=8.0的Tris-HCl,50mM EDTA,0.35M山梨醇Sorbitol,质量比为1%的聚乙烯吡咯烷酮PVP-40。
3.根据权利要求1或2所述的一种从单粒稻米胚乳中提取高质量基因组DNA的方法,其特征在于:所述的DNA提取缓冲液其成分包括:质量比2%CTAB,100mM Tris-HCl,25mM EDTA,15M NaCl,质量比1%PVP-40,0.1mg/mL 蛋白酶K,质量比0.5%NP-40,质量比0.5% Tween-20。
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