[发明专利]分子动力学计算的实现方法和装置在审
| 申请号： | 201110403579.2 | 申请日： | 2011-12-06 |
| 公开（公告）号： | CN103150463A | 公开（公告）日： | 2013-06-12 |
| 发明（设计）人： | 何牧君;何沧平;马少杰;陈伟;占杰;李斌;吴宏文;顾小宝;曹征 | 申请（专利权）人： | 曙光信息产业股份有限公司 |
| 主分类号： | G06F19/00 | 分类号： | G06F19/00 |
| 代理公司： | 北京德恒律师事务所 11306 | 代理人： | 陆鑫;房岭梅 |
| 地址： | 300384 天津市西青区华*** | 国省代码： | 天津;12 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 分子 动力学 计算 实现 方法 装置 | ||
1.一种分子动力学计算的实现方法，其特征在于，包括：
接收用户通过图形化界面输入的计算任务；
将所述计算任务中需要计算的数据分配给图形处理器GPU和中央处理器CPU；
所述GPU和所述CPU根据分子动力学的计算方法，对各自分配到的所述需要计算的数据进行分子动力学计算。
2.根据权利要求1所述的实现方法，其特征在于，将需要计算的数据分配给GPU和CPU包括：
根据所述GPU和所述CPU的处理能力，对所述GPU和所述CPU分别分配需要处理的数据。
3.根据权利要求2所述的实现方法，其特征在于，将需要计算的数据分配给GPU和CPU包括：
将需要计算的数据分批次分配给所述GPU和所述CPU。
4.根据权利要求3所述的实现方法，其特征在于，进一步包括：
在所述GPU和所述CPU进行分子动力学计算的过程中，根据所述GPU和所述CPU的处理能力的变化情况，动态调整每批次对所述GPU和所述CPU分配的需要计算的数据量。
5.根据权利要求4所述的实现方法，其特征在于，在首次分配需要计算的数据给所述GPU和所述CPU的情况下，所述方法进一步包括：
通过应用程序编程接口API获取所述GPU的标称处理能力。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的实现方法，其特征在于，所述CPU的数量为至少一个；所述GPU的数量为至少一个。
7.一种分子动力学计算的实现装置，其特征在于，包括：
至少一个CPU；
至少一个GPU；
界面提供模块，用于提供图形化界面，并接收用户通过所述图形化界面输入的计算任务；
分配模块，用于将所述计算任务中需要计算的数据分配给所述GPU和所述CPU；
并且，所述GPU和所述CPU用于根据分子动力学的计算方法，对各自分配到的所述需要计算的数据进行分子动力学计算。
8.根据权利要求7所述的实现装置，其特征在于，所述分配模块进一步用于根据所述GPU和所述CPU的处理能力，对所述GPU和所述CPU分别分配需要处理的数据。
9.根据权利要求8所述的实现装置，其特征在于，所述分配模块进一步用于将需要计算的数据分批次分配给所述GPU和所述CPU。
10.根据权利要求9所述的实现装置，其特征在于，所述分配模块进一步用于在所述GPU和所述CPU进行分子动力学计算的过程中，根据所述GPU和所述CPU的处理能力的变化情况，动态调整每批次对所述GPU和所述CPU分配的需要计算的数据量。
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