[发明专利]诊断高胆红素血症的SNP、生物标志物及单倍型区块tagSNPs集合

说明书

技术领域

本发明涉及一种生物技术领域内的SNP、生物标志物及单倍型区块tagSNPs集合，具体涉及一种诊断高胆红素血症的SNP、生物标志物及单倍型区块tagSNPs集合。

背景技术

高胆红素血症是指胆红素在生理代谢过程中出现的代谢速率缓慢或代谢障碍而导致在体内累积的疾病，在临床上主要表现为黄疸症状。高胆红素血症主要包括三种：Crigler-Najjar I(CN I)，Crigler-Najjar II(CN II)和Gilbert综合症(GS)。CN I和CNII，是发生于新生儿和婴幼儿的遗传性高胆红素血症，前者由于多伴有胆红素脑病，胆红素的神经毒性作用引起脑组织的病理性损害，如不及早防治可致后遗症或死亡，并且临床药物治疗无效，I型病人预后不良，大多数在出生后18个月内死于胆红素脑病或后遗症；II型患者病情较I型相对较轻，无神经系统症状，智力发育亦正常，黄疸程度稍低，药物苯巴比妥可辅助治疗，II型预后比I型好，轻型患者或可存活至成年。Gilbert综合症，病人主要为青少年，男性多见，临床表现特点为长期间歇性轻度黄疸，多无明显症状，发病率大约为5％左右。

传统的临床诊断方法是测定患者的总胆红素水平及间接胆红素水平，但由于受个体差异，民族、地区、性别、喂养方式等多种因素的影响，黄疸胆红素浓度诊断标准常常不适用，例如早产儿，低出生体重儿等，经常由于不能早发现早干预而导致新生儿致残与死亡。正是由于传统的高胆红素血症的诊断方法具有不稳定性及不确定性，因此，寻找并制定一个持之有效的新标准来实现胆红素代谢疾病的诊断与预测预防非常重要。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术的不足，提供一种诊断高胆红素血症的SNP、生物标志物及单倍型区块tagSNPs集合。本发明避开患者胆红素浓度生理指标的波动性和个体差异性，从遗传因素出发，基于疾病关联性分析以及胆红素代谢酶编码基因内单核苷酸多态性(SNP)的连锁分析，筛选出具有生物学意义的代表性生物标志物，这些生物标志物的存在状态决定了个体患病的风险。通过鉴定个体基因组内特定生物标志物的遗传状态，来评估患胆红素代谢疾病的风险性，从而达到早预测、早诊断、早干预、早治疗的目的。

本发明的目的是通过以下技术方案来实现的：

第一方面，本发明涉及一种用于诊断高胆红素血症的SNP位点，所述SNP位点为表中所示的15种SNP位点中的一种：

。

优选地，所述高胆红素血症为三类先天性非溶血性黄疸，具体为CN I、CN II和Gilbert综合症。

第二方面，本发明还涉及一种用于诊断高胆红素血症的生物标志物，所述生物标志物为1A4 intron SNP c.867+101G＞T。

进一步地，本发明还提供了一种用于诊断高胆红素血症的单倍型区块tagSNPs集合，所述单倍型区块tagSNPs集合为：

Block 9单倍型tagSNP集c.-688A＞C，c.-118_-117insT；

Block 9/7/6单倍型tagSNP集c.855+152G＞A，c.855+399G＞A，c.855+485G＞A，c.855+642G＞A，p.K131Q，p.R208W，c.756G＞A，c.351A＞G，p.T181A；

Block 5单倍型tagSNP集p.L248I，c.792T＞C；

Block 4/3单倍型tagSNP集c.804G＞A，c.-66T＞C，p.R45W，p.V47A，c.477A＞G；

Block3’UTR单倍型tagSNP集c.1602+211T＞C，c.1602+339G＞C。

与现有技术相比，本发明具有的有益效果为：本发明提供了能够诊断高胆红素血症的SNP、生物标志物及单倍型区块tagSNPs集合；通过对本发明提供的与致病SNP位点连锁的标志物SNP进行基因分型(genotyping)，即可从检测出个体是否有患病的风险，并且可根据具体标志物SNP位点的不同，诊断出个体的患高胆红素血症的具体类型，达到早预测、早诊断、早干预、早治疗的目的；同时，本发明提供生物标志物还可用于诊断试剂盒的开发，并能够应用于临床研究、分析及诊断等诸多用途。

附图说明

图1为UGT1基因簇结构图；

图2为中国人群UGT1基因簇SNP连锁图谱；

图3为UGT1基因簇内各单倍型区块内的单倍型类型及频率示意图；