[发明专利]铂类药物疗效相关基因SNP检测特异性序列和液相芯片

权利要求书

1.一种铂类药物疗效相关基因SNP检测液相芯片，其特征是，包括有：

(1).针对XRCC1基因的G1301A SNP位点设计的野生型和突变型特异ASPE引物对，每种ASPE引物由3’端的针对目的基因SNP位点的特异性序列和5’端的tag序列组成，所述野生型及突变型特异性ASPE引物对为SEQ ID NO.7及SEQ ID NO.8；

(2).分别包被有特异的anti-tag序列的微球，所述anti-tag序列能相应地与(1)中所选tag序列互补配对；所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.17～SEQ ID NO.18中的序列；

(3).针对XRCC1基因的G1301ASNP位点的目标序列的扩增引物。

2.根据权利要求1所述的铂类药物疗效相关基因SNP检测液相芯片，其特征是，(3)中所述引物为：针对G1301A的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28。

3.根据权利要求1所述的铂类药物疗效相关基因SNP检测液相芯片，其特征是，(2)中所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列。

4.根据权利要求3所述的铂类药物疗效相关基因SNP检测液相芯片，其特征是，所述间隔臂序列为5-10个T。

5.一种铂类药物疗效相关基因SNP检测液相芯片，其特征是，主要包括有：

(1).针对每种型别的SNP位点分别设计的野生型和突变型特异ASPE引物，每种ASPE引物由3’端的针对目的基因SNP位点的特异性序列和5’端的tag序列组成，所述野生型及突变型特异性ASPE引物对为：针对XRCC1基因的G1301A的SEQ ID NO.7及SEQ IDNO.8，以及选自针对ERCC1基因的C19007T的SEQ ID NO.1及SEQ ID NO.2、针对ERCC1基因的C8092A的SEQ ID NO.3及SEQ ID NO.4、针对ERCC2基因的A2282C的SEQ IDNO.5及SEQ ID NO.6、和针对GSTP1基因的A1578G的SEQ ID NO.9及SEQ ID NO.10中的一对以上；

(2).分别包被有特异的anti-tag序列的10种微球，所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列，所述anti-tag序列能相应地与(1)中所选tag序列互补配对；所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.11～SEQ ID NO.20中的序列；

(3).扩增出具有需要检测的、相应SNP位点的目标序列的引物对：针对XRCC1基因的G1301A的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28，以及选自针对ERCC1基因的C19007T的SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22、针对ERCC1基因的C8092A的SEQ ID NO.23及SEQ IDNO.24、针对ERCC2基因A2282C的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26、和针对GSTP1基因的A1578G的SEQ ID NO.29及SEQ ID NO.30中的一对以上。

6.根据权利要求5所述的铂类药物疗效相关基因SNP检测液相芯片，其特征是，(2)中所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列。

7.根据权利要求6所述的铂类药物疗效相关基因SNP检测液相芯片，其特征是，所述间隔臂序列为5-10个T。

8.一种用于铂类药物疗效相关基因SNP检测的特异性序列，其特征是，所述特异性序列包括有针对XRCC1基因的G1301A的SNP位点的SEQ ID NO.37及SEQ ID NO.38。

9.根据权利要求8所述的铂类药物疗效相关基因SNP检测液相芯片，其特征是，所述特异性序列还包括有：针对ERCC1基因的C19007T的SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32、针对ERCC1基因的C8092A的SEQ ID NO.33及SEQ ID NO.34、针对ERCC2基因的A2282C的SEQ ID NO.35及SEQ ID NO.36、和/或针对GSTP1基因的A1578G的SEQ ID NO.39及SEQ ID NO.40。