[发明专利]一种染料及其制备方法与在检测特殊DNA二级结构中的应用有效

专利信息
申请号: 201110273189.8 申请日: 2011-09-15
公开(公告)号: CN102408741A 公开(公告)日: 2012-04-11
发明(设计)人: 黄志纾;古练权;谭嘉恒;颜金武;叶文杰 申请(专利权)人: 中山大学
主分类号: C09B23/14 分类号: C09B23/14;C09B23/10;C12Q1/68;G01N21/25;G01N21/33
代理公司: 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 代理人: 陈卫
地址: 510275 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 染料 及其 制备 方法 检测 特殊 dna 二级 结构 中的 应用
【权利要求书】:

1.一种染料,其特征在于结构式为:

式中-Ar为芳香环或芳香杂环;

R为H、F、Cl、Br、I、烷基、环烷基、胺类取代基、硝基、羧基取代基中的一种;

A-为阴离子。

2.如权利要求1所述的染料,其特征在于所述的A-为N原子甲基化反应后的阴离子。

3.一种如权利要求1或2所述的染料的制备方法,其特征在于包括以下步骤:

先用甲基化试剂,将2-甲基苯并噻唑甲基化,得到化合物再将2-吡咯酮与邻氨基苯甲酸混合,在三氯氧磷存在下,关环反应得到化合物将其与甲基化试剂反应,甲基化后得到化合物将其与化合物反应,得到化合物再将其与带取代的芳香醛反应,得到最终染料化合物

4.如权利要求1或2所述的染料在检测DNA特殊二级结构上的应用。

5.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述应用中,通过如下方法检测G-四链体结构:

1)将待测DNA溶于PH值7.2-7.4的缓冲液,得到溶液A;将该染料溶解,再用PH值7.2-7.4的缓冲液稀释,得到溶液B;

2)将溶液A和溶液B混合,使混合液中待测DNA与染料的摩尔比大于等于1小于等于3,混合后3到5分钟,对混合液进行颜色观察或者紫外可见光谱分析;

2.1)与溶液B对比,若混合液有明显的颜色变化,出现染料单体的颜色,即可判断待测DNA为G-四链体结构;若混合液的颜色与溶液B的颜色一样或者只有非常微弱的变化,仍为聚集体的颜色,既可以判断待测DNA样品为非G-四链体结构;

2.2)也可以对混合液进行紫外可见吸收光谱分析,与溶液B相比,若混合液紫外可见吸收光谱中最大吸收峰明显红移至染料单体特征峰,则可以判断待测DNA为G-四链体结构;若混合液的紫外可见吸收光谱与溶液B相比,最大吸收峰没有明显的红移现象,则可以判断待测DNA为非G-四链体结构。

6.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述应用中,通过如下方法检测i-motif结构:

1)将待测DNA溶于PH值5.5-6.0的缓冲液,得到溶液C;将该染料溶解,再用PH值5.5-6.0的缓冲液稀释,得到溶液D;

2)将溶液C和溶液D混合,是混合液中待测DNA与染料的摩尔比大于等于1小于等于3,混合后3到5分钟,对混合液进行颜色观察或者紫外可见光谱分析;

2.1)与溶液D对比,若混合液有明显的颜色变化,出现染料单体的颜色,即可判断待测DNA为i-motif结构;若混合液的颜色与溶液C的颜色一样或者只有非常微弱的变化,仍为聚集体的颜色,既可以判断待测DNA样品为非i-motif结构;

2.2)也可以对混合液进行紫外可见吸收光谱分析,与溶液D相比,若混合液紫外可见吸收光谱中最大吸收峰明显红移至染料单体特征峰,则可以判断待测DNA为i-motif结构;若混合液的紫外可见吸收光谱与溶液D相比,最大吸收峰没有明显的红移现象,则可以判断待测DNA为非i-motif结构。

7.如权利5和权利6所述的应用,其特征在于,所述缓冲液为Tris-盐酸缓冲液或者Tris-醋酸缓冲液;所述染料用二甲基亚砜溶解。

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