[发明专利]一种CYP2C8基因多态性检测特异性引物和液相芯片有效

专利信息
申请号: 201110219242.6 申请日: 2011-08-02
公开(公告)号: CN102912005A 公开(公告)日: 2013-02-06
发明(设计)人: 许嘉森;邹凤文 申请(专利权)人: 广州益善生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 代理人: 万志香;曾旻辉
地址: 510663 广东省广州市广州科*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 cyp2c8 基因 多态性 检测 特异性 引物 芯片
【说明书】:

技术领域

发明属于分子生物学领域,涉及医学和生物技术,具体的是涉及一种CYP2C8基因多态性检测特异性引物和液相芯片。

背景技术

细胞色素P450酶系是一个超家族,由同源性基因编码的酶蛋白组成,在人基因组中含有57种CYP基因,编码相应的CYP酶,其中CYP1、CYP2和CYP3家族最为重要。CYP2C8是一种重要的肝脏CYP酶,占肝脏CYP总量的7%,参与I相代谢中近15%的药物催化过程,抗癌药物紫杉醇是CYP2C8的特异性代谢底物,紫杉醇的6a-羟基化反应是CYP2C8体外检测最常用的标志反应,同时,CYP2C8也是肝肾中将花生四烯酸转化为具有活性的二十碳三烯酸的主要CYP酶。

CYP2C8编码基因为30kb,其开方阅读框编码490个氨基酸,在其开方阅读框区域内,已发现很多单核苷酸多态性(SNPs)位点,该多态性位点与药物的代谢相关。

本发明目标检测的CYP2C8基因突变位点(多态性位点),如表所示:

  序号  CYP2C8位点突变的内容  简写  1  SEQ ID NO.55的第127位核苷酸,发生A→T突变  A127T  2  SEQ ID NO.56的第124位核苷酸,发生A→G突变  A124G  3  SEQ ID NO.57的第145位核苷酸,发生G→A突变  G145A  4  SEQ ID NO.57的第204位核苷酸,缺失碱基A  204delA  5  SEQ ID NO.58的第115位核苷酸,发生C→G突变  C115G  6  SEQ ID NO.59的第315位核苷酸,发生G→C突变  G315C

目前,对CYP2C8基因多态性进行检测、分析的方法主要有:直接测序法和PCR-RFLP分析法等,其中最常用的方法有PCR-RFLP分析法。PCR-RFLP法是基于基因突变造成的限制性内切酶识别位点的改变,如位点丢失或产生新位点,通过PCR扩增某一特定片段,再用限制性内切酶酶切扩增产物,电泳观察片段的大小,这种方法用于检测酶切位点改变的基因突变,可直接判断基因型,但该法不能用于没有产生新酶切位点的基因突变检测。再次,以上这些方法都存在着检测通量的局限性,每次只能检测一种突变类型,不能满足实际应用的需要。

发明内容

本发明的目的之一是提供CYP2C8基因多态性检测液相芯片,该液相芯片可用于检测CYP2C8基因六种常见基因型A127T、A124G、G145A、204delA、C115G和G315C的野生型和突变型。

实现上述目的的技术方案如下:

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