[发明专利]检测肺癌蛋白的质谱模型及构建方法有效
申请号: | 201110216986.2 | 申请日: | 2011-07-29 |
公开(公告)号: | CN102323246A | 公开(公告)日: | 2012-01-18 |
发明(设计)人: | 马庆伟;赵艳梅;胡晓慧;任晶 | 申请(专利权)人: | 毅新兴业(北京)科技有限公司 |
主分类号: | G01N21/64 | 分类号: | G01N21/64;G01N1/28 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 张庆敏 |
地址: | 100080 北京市海淀区苏*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 肺癌 蛋白 模型 构建 方法 | ||
1.用于检测肺癌特征蛋白的质谱标记,其包括质荷比为4054m/z、2273m/z、4091m/z、3955m/z、3192m/z、3884m/z和5337m/z的峰。
2.根据权利要求1所述的质谱标记,其特征在于,所述的表征质荷比为4054m/z、2273m/z、4091m/z、3955m/z、3192m/z、3884m/z和5337m/z的多肽的氨基酸序列分别如SEQ ID No.1、SEQ ID No.2、SEQ ID No.3、SEQ ID No.4、SEQ ID No.5、SEQ ID No.6和SEQ IDNo.7所示。
3.用于检测肺癌特征蛋白的质谱模型,其特征在于,该质谱模型中包含质荷比为4054m/z、2273m/z、4091m/z、3955m/z、3192m/z、3884m/z和5337m/z的峰,其中,当4054m/z、2273m/z、4091m/z、3955m/z、3192m/z的峰都下调表达,以及3884m/z和5337m/z的峰上调表达时预示为肺癌患者或潜在患者。
4.建立权利要求3所述质谱模型的方法,包括如下步骤:
1)收集多例临床确诊的肺癌患者血清和正常对照人员的血清作为两组血清标本,进行低温冷冻备用;
2)对血清蛋白进行质谱前预处理;
3)对预处理过的两组血清蛋白进行质谱检测读取,获得两组血清多肽的指纹图谱;
4)对所有的肺癌患者和正常人血清多肽的指纹图谱进行标准化处理,并收集数据;
5)对所得数据进行标准化处理,筛选出具有下列质荷比峰的七个肺癌特征蛋白:4054m/z、2273m/z、4091m/z、3955m/z、3192m/z、3884m/z和5337m/z,对差异多肽4054m/z、2273m/z、4091m/z、3955m/z、3192m/z、3884m/z和5337m/z进行多肽序列测定,根据这七个质荷比峰建立检测肺癌特征蛋白的质谱模型。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,其中步骤2)预处理的方法包括使用磁珠纯化和稳定样品中的血清蛋白或多肽。
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