[发明专利]一种NAT2基因多态性检测特异性引物和液相芯片

说明书

技术领域

本发明属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种NAT2基因多态性检测特异性引物和液相芯片。

背景技术

N2乙酰基转移酶2基因(N2 acetyltransferase 2 gene，NAT2)位于人类第8对染色体短臂2区2带(8p22)，编码区长870bp，主要编码药物II相代谢酶-N2乙酰基转移酶。NAT2基因多态性主要存在7个位点的突变，某些位点突变将直接导致其编码代谢酶活性改变，从而影响其对一些药物代谢以及致癌物质的灭活或活化，因而导致一些药物相关性疾病及癌症的发生。

目前，检测NAT2基因多态性最常用的是聚合酶链反应(polymerase chain reaction，PCR)-限制性片段长度多态法(RFLP)，但其特异性相对直接测序法和实时荧光PCR较低，操作相对也较繁琐；直接测序法特异性、敏感性最高，但检测时宜选用单克隆PCR产物测序，且过程复杂，影响因素多，耗时较长，价格较昂贵，对于筛查或大样本研究经济上难以承受；PCR-单链构象多态法、反向点杂交法也有不少研究运用，但其敏感性、特异性也易受操作条件影响；荧光定量PCR具有操作简便、结果快捷、量化等优点，但是，该技术存在样品易污染，易发生交叉反应，假阳性率高的缺点。此外，以上方法都存在着检测通量的局限性，每次只能检测一种突变类型，不能满足实际应用的需要。本发明目标检测的NAT2基因突变位点，如表所示：

  序号  NAT2位点突变的内容  简写  1  SEQ ID NO.53的第99位核苷酸，发生G→A突变  G99A  2  SEQ ID NO.53的第190位核苷酸，发生C→T突变  C190T  3  SEQ ID NO.53的第249位核苷酸，发生T→C突变  T249C  4  SEQ ID NO.53的第389位核苷酸，发生C→T突变  C389T  5  SEQ ID NO.53的第498位核苷酸，发生G→A突变  G498A  6  SEQ ID NO.53的第711位核苷酸，发生A→G突变  A711G  7  SEQ ID NO.53的第765位核苷酸，发生G→A突变  G765A

发明内容