[发明专利]一种检测秦川牛AMPD1基因连锁突变的方法无效
| 申请号: | 201110117706.2 | 申请日: | 2011-05-09 |
| 公开(公告)号: | CN102363803A | 公开(公告)日: | 2012-02-29 |
| 发明(设计)人: | 刘小林;贺花;张慧林 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 712100 陕*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 检测 秦川 ampd1 基因 连锁 突变 方法 | ||
1.一种检测秦川牛AMPD1基因连锁突变的PCR-SSCP方法,其特征在 于,以包含AMPD1基因的待测秦川牛全基因组DNA序列为模板,在2× Reaction Mix、ddH2O、Forward primer、Reverse primer、Golden DNA polymerase、 DNA模板存在的情况下,设计聚合酶链式反应引物,在PCR反应程序下进行 扩增,扩增后对PCR产物进行变性,然后再对变性后的扩增片段进行聚丙烯 酰胺凝胶电泳,利用凝胶成像系统分析,并鉴定其多态片段,得秦川牛AMPD1 基因第11内含子区域第19416位和第19421位分别发生了T>C和A>G的 单核苷酸多态性;
所述的聚合酶链式反应引物为:
上游引物:
5′-AACCCTCAGGCTCACCCA-3′18bp;
下游引物:
5′-GGGCTTAGGGCTCTTGGA-3′18bp。
2.根据权利要求1所述的检测秦川牛AMPD1基因连锁突变的PCR-SSCP 方法,其特征在于,所述的PCR反应程序为:
95℃预变性5min,94℃30s,60℃40s,72℃40s,共36个循环, 最后72℃延伸10min,4℃保存。
3.根据权利要求1所述的检测秦川牛AMPD1基因连锁突变的PCR-SSCP 方法,其特征在于,所述的PCR反应体系为:
总体积为15μL的反应体系,包括2×Reaction Mix 7.5μL,ddH2O 6.1μL, 上游引物0.3μL,下游引物0.3μL,Golden DNA polymerase 0.2μL,含AMPD1 基因序列的DNA模板0.6μL。
4.根据权利要求1所述的检测秦川牛AMPD1基因连锁突变的PCR-SSCP 方法,其特征在于,所述的聚丙烯酰胺凝胶浓度为10%。
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