[发明专利]一种香蕉穿孔线虫特异性LAMP检测方法及其应用有效

专利信息
申请号: 201110032956.6 申请日: 2011-01-31
公开(公告)号: CN102154476A 公开(公告)日: 2011-08-17
发明(设计)人: 彭德良;彭焕;王琼 申请(专利权)人: 中国农业科学院植物保护研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京兆君联合知识产权代理事务所(普通合伙) 11333 代理人: 初向庆
地址: 100193 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 香蕉 穿孔 线虫 特异性 lamp 检测 方法 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种香蕉穿孔线虫特异性LAMP检测方法,其特征在于:其中的LAMP反应体系中所使用的引物分别是:

RSF3:5’-AGCTGGCGTATCTAGCCTG-3’,

RSB3:5’-AACGCCAGAACGCACAAC-3’,

RSFIP:5’-GCACCCAACGGACAAAACAACA-CATTCAGCCTCTGGGCATC-3’,

RSBIP:5’-GCAGCGCTGTGAGCCTGTTT-GTTCGCCCATTCTGGGTAC-3’,

RSLF:5’-AGGCGTCGTCCCAAGGTCA-3’。

2.根据权利要求1所述的检测方法,所述LAMP反应体系包括:引物混合液、反应混合液和1μL DNA模板,用灭菌双蒸馏水补全到25μL,所述引物混合液为外侧引物RSF3和RSB3各0.2μM,内侧引物RSFIP和RSBIP各1.6μM,环引物RSLF为0.4μM;所述反应混合液为20mM Tris-HCl,10mM(NH4)2SO4,10mM KCl,8mM MgSO4,0.1%Triton X-100,0.8MBetaine,1.4mM dNTPs,8U Bst DNA聚合酶大片段。

3.根据权利要求2所述的检测方法,所述LAMP反应的条件为在61-65℃温育30-90min,82℃保温5-10min。

4.根据权利要求3所述的检测方法,所述LAMP反应的最终扩增产物中加入有显色剂,所述显色剂为SYBR green I与PCR级DMSO混合液,其体积比为1∶9。

5.根据权利要求1所述的检测方法,所述DNA模板为从罹病香蕉穿孔线虫病的植物组织中提取。

6.根据权利要求5所述的检测方法,所述提取的方法为:截取0.2-0.5cm长的罹病植物组织放入装有48μL的LA缓冲液的离心管中,加入2μL的LB提取液,混合均匀后离心,放入液氮中速冻,用研磨棒将其捣碎,点动离心后将离心管放入65℃条件下温育45min,95℃下反应10min,冷却至室温,点动离心后的上清液即可作为线虫DNA模板,所述LA提取液为100mM NaCl,pH 8.5的100mM Tris-HCl,pH 7.4的50mM EDTA,1%SDS和1%巯基乙醇组成,LB提取液为20mg/mL蛋白酶K。

7.一种香蕉穿孔线虫特异性LAMP检测试剂盒,包括:

1)引物混合液:外侧引物RSF3和RSB3各0.2μM,内侧引物RSFIP和RSBIP各1.6μM,环引物RSLF为0.4μM,

2)反应混合液:20mM Tris-HCl,10mM(NH4)2SO4,10mM KCl,8mM MgSO4,0.1%Triton X-100,0.8M Betaine,1.4mM dNTPs,8U Bst DNA聚合酶大片段。

8.根据权利要求7所述的试剂盒,还包括显色剂,所述显色剂为SYBR green I与PCR级DMSO混合液,体积比为1∶9。

9.根据权利要求7所述的试剂盒,还包括从罹病植物组织中香蕉穿孔线虫DNA提取试剂,由LA提取液和LB提取液组成,所述LA提取液由100mM NaCl,pH 8.5的100mMTris-HCl,pH 7.4的50mM EDTA,1%SDS和单独分装的占总体积比为1%巯基乙醇组成,LB提取液为20mg/mL蛋白酶K。

10.权利要求1-6任一香蕉穿孔线虫特异性LAMP分子检测方法或权利要求7-9任一试剂盒在诊断植物、土壤中的香蕉穿孔线虫感染情况或鉴别香蕉穿孔线虫中的应用。

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