[发明专利]用于鉴定、评估、预防和治疗癌症的组合物、试剂盒和方法

权利要求书

1.一种确定肿瘤或癌细胞或受试者对包括HSP90抑制剂的治疗的响应性的方法，所述受试者具有所述肿瘤或癌细胞或处于具有所述肿瘤或癌细胞的风险，所述方法包括：

(i)检测所述肿瘤或癌细胞中ALK、MAPK途径和/或EGFR基因或基因产物中的改变；和/或

(ii)评价以下一项或多项：a)所述肿瘤或癌细胞组织结构，b)所述受试者的吸烟状态，或c)HSP90在所述肿瘤或癌细胞中的水平或表达，从而确定所述肿瘤或癌细胞对包括HSP90抑制剂的治疗的响应性。

2.一种鉴定罹患癌症或肿瘤有或处于罹患癌症或肿瘤的风险的受试者具有对包括HSP90抑制剂的治疗响应的可能性的方法，所述方法包括以下一项、两项、三项或四项：

(i)检测来自所述受试者的样本中ALK、MAPK途径和/或EGF基因或基因中的改变的存在或不存在；

(ii)检测来自所述受试者的样本中癌性组织结构的存在或不存在；

(iii)确定所述受试者的吸烟状态；或

(iv)确定来自所述受试者的样本中HSP90的水平或表达，从而鉴定所述受试者可能或不可能对包括HSP90抑制剂的治疗响应。

3.一种监测或预测包括HSP90抑制剂的治疗在受试者中治疗癌症或肿瘤的功效的方法，所述方法包括

(i)检测从所述受试者获得的样本中ALK、MAPK途径和/或EGFR基因或基因产物中的改变的中存在或不存在；和/或

(ii)评价以下一项或多项：a)来自所述受试者的样本中癌性组织结构的存在或不存在；b)所述受试者的吸烟状态；或c)HSP90的水平或表达；并且

(iii)将在(i)和/或(ii)中检测到的改变或评价结果与参考样本比较，其中所述样本中检测到的改变或评价结果相对于所述参考样本的差异的程度指示或预示所述治疗的功效。

4.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中以下一项或多项指示对包括HSP90抑制剂的治疗响应的可能性增加：(i)检测所述组织结构中非小细胞肺癌、鳞状细胞或结直肠癌细胞或组织的存在；(ii)鉴定所述受试者为例如具有至少5、10、15或更长包年吸烟史的吸烟者；或(iii)检测升高的HSP90水平或表达。

5.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中检测到或存在ALK基因或基因产物中的改变表明所述肿瘤、所述癌细胞或所述受试者对包括HSP90抑制剂的治疗响应的可能性增加。

6.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述MAPK途径基因或基因产物选自H-Ras、N-Ras、K-Ras、A-Raf、B-Raf(BRAF)、C-Raf、Mek或Erk中一种或多种。

7.如权利要求1-3中任一项所述的方法，还包括检测选自EGFR、PIK3CA、PTEN、AKT、TP53(p53)、CTNNB1(β-连环蛋白)、APC、KIT、JAK2、NOTCH、FLT3、RSK、ETS、ELK-1或SAP-1的一种或多种基因产物中的改变。

8.如权利要求6所述的方法，其中检测到或存在MAPK途径基因或基因产物中的改变表明所述肿瘤或癌细胞对包括HSP90抑制剂作为单一药剂的治疗响应的可能性增加。

9.如权利要求6所述的方法，其中检测到或存在MAPK途径基因或基因产物中的改变表明所述肿瘤或癌细胞对包括与第二药剂组合的HSP90抑制剂的治疗响应的可能性增加。

10.如权利要求5所述的方法，其中检测到或存在ALK基因或基因产物中的改变表明对包括HSP90抑制剂作为单一药剂或组合以抑制、减少或治疗NSCLC肿瘤或癌细胞的治疗响应的可能性增加。

11.如权利要求6所述的方法，其中检测到或存在K-Ras基因或基因产物中的改变表明对包括HSP90抑制剂作为单一药剂或组合以抑制、减少或治疗结直肠肿瘤或癌细胞的疗法响应的可能性增加。

12.如权利要求6所述的方法，其中检测到或存在B-Raf基因或基因产物中的改变表明对包括HSP90抑制剂作为单一药剂或组合以抑制、减少或治疗结直肠肿瘤或癌细胞的疗法响应的可能性增加。