[发明专利]猿腺病毒41及其应用

说明书

关于联邦资助下研发的声明

本项工作部分受到国立卫生研究院的基金，NIH基金号P30-DK47757的支持。美国政府对本发明享有一定权利。

电子形式提交的资料通过引用纳入

申请人将以电子形式提交的序列表材料通过引用纳入本文。这些文件标记为“UPN-U4710PCT_ST25.txt”。

发明背景

腺病毒是双链DNA病毒，基因组大小约为36千碱基(kb)，由于能在多种靶组织中实现高效基因转移以及较大的转基因容量，它被广泛用于基因转移应用。通常，腺病毒的E1基因缺失，被替换为由所选启动子、感兴趣基因cDNA序列和聚A信号组成的转基因盒，从而产生复制缺陷型重组病毒。

腺病毒的形态特征是由三种主要蛋白和许多其他小蛋白VI、VIII、IX、IIIa和Iva2组成的二十面体衣壳，这三种主要蛋白是六邻体(II)、五邻体基质(III)和突结尾丝(knobbed fibre)(IV)[W.C.Russell，J.Gen Virol.，81：2573-3704(2000年11月)]。病毒基因组为线形双链DNA，末端蛋白共价连接于含有反向末端重复(ITR)的5’末端。病毒DNA与高碱性蛋白VII和小肽pX(之前称为mu)密切相连。另一种蛋白V与此DNA-蛋白复合物包装在一起，并通过蛋白VI提供与衣壳的结构连接。该病毒也含有病毒编码的蛋白酶，这种蛋白酶是加工某些结构蛋白以产生成熟的感染性病毒所必需的。

已经开发了一种对包括人、猿、牛、马、猪、羊、犬和负鼠腺病毒在内的哺乳动物腺病毒家族进行分类的方法。这种分类方法的开发依据该家族内的腺病毒序列凝集红血细胞的能力不同。结果得到了六个亚组，现在称为亚组A、B、C、D、E和F。参见T.Shenk等，“腺病毒科：病毒及其复制”(Adenoviridae：The Viruses and their Replication)，选自B.N Fields等编的《菲尔德病毒学》(FIELD′S VIROLOGY)第6版，第67章，(LR出版社(Lippincott Raven Publishers)，费城，1996)，第111-2112页。

已报道可使用重组腺病毒将异源分子递送至宿主细胞。参见美国专利6,083,716，它描述了两种黑猩猩腺病毒的基因组。猿腺病毒C5、C6和C7已经描述于美国专利7,247,472，它可用作疫苗载体。其他黑猩猩腺病毒描述于WO 2005/1071093，可用于制造腺病毒疫苗载体。

本领域需要其它腺病毒分离物用于制备可用于治疗和/或免疫应用的载体。

发明概述

本文提供了猿腺病毒41(SAdV-41)的分离核酸序列和氨基酸序列，以及含有这些序列的载体。还提供了利用本发明载体和细胞的许多方法。

本文所述方法包括通过给予本发明的载体将一种或多种所选异源基因递送给哺乳动物患者。用本文所述组合物进行疫苗接种能够呈递所选抗原从而引发保护性免疫反应。基于猿腺病毒41的载体也可用于体外产生异源基因产物。此类基因产物可用于各种目的，例如本文描述的。

下文将更加详细地描述本发明的这些和其它实施方式以及优点。

发明详述

本发明提供了分离自黑猩猩排泄物的猿腺病毒41的新型核酸和氨基酸序列。还提供了新型腺病毒载体和产生那些载体的包装细胞系，以便用于体外产生重组蛋白质或片段或其它制剂。还提供了用于递送异源分子的组合物以供治疗或疫苗目的。此类治疗性或疫苗组合物含有携带插入的异源分子的腺病毒载体。此外，所述新型SAdV-41序列可用于提供产生重组腺相关病毒(AAV)载体所必需的辅助功能。因此，提供了在此种产生方法中利用这些序列的辅助构建物、方法和细胞系。