[发明专利]结构化肽加工

权利要求书

1.一种用于制备一种或多种肽配体的方法，所述肽配体包含在两个或更多个氨基酸残基上与分子支架共价连接的多肽，所述方法包括以下步骤：

(a)在遗传展示系统中展示一种或多种肽配体，其中所述多肽包含两个或更多个与所述分子支架形成共价键的活性基团，和至少一个环，所述环包含位于两个所述活性基团之间的两个或更多个氨基酸的序列；

(b)将所述肽配体暴露于一种或多种蛋白酶；和

(c)针对靶标结合筛选所述肽配体，并选择与所述靶标结合的配体。

2.一种用于制备一种或多种肽配体的方法，所述肽配体包含在两个或更多个氨基酸残基上与分子支架共价连接的多肽，所述方法包括下述步骤：

(a)在遗传展示系统中展示一种或多种肽配体，其中所述多肽包含两个或更多个与所述分子支架形成共价键的活性基团，和至少一个环，所述环包含位于两个所述活性基团之间的两个或更多个氨基酸的序列；

(b)针对靶标结合筛选所述肽配体，并选择与所述靶标结合的配体；

(c)将与所述靶标结合的肽配体暴露于一种或多种蛋白酶；和

(d)针对靶标结合进一步筛选所述肽配体。

3.权利要求1或权利要求2的方法，其中所述遗传展示系统为噬菌体展示。

4.前述权利要求中任一项的方法，其中针对与所述靶标的结合而选择的肽配体，抵抗蛋白酶切割。

5.前述权利要求中任一项的方法，其中在还原剂存在的情况下暴露于所述蛋白酶。

6.前述权利要求中任一项的方法，其中所述一种或多种肽配体是肽配体库。

7.一种肽配体库，所述肽配体各自包含以下多肽，其含有与分子支架共价连接的两个或更多个活性基团，和至少一个环，所述环包含位于两个所述活性基团之间的两个或更多个氨基酸的序列，所述库是蛋白酶抗性的。

8.权利要求7的库，其是首次用于实验的。

9.权利要求7的库，其已针对与一个或多个靶标的结合进行选择。

10.权利要求7-10中任一项的库，其中各个多肽包含三个或更多个与分子支架共价连接的活性基团。

11.权利要求1-3中任一项的方法，其中针对与所述靶标的结合而选择的肽配体，对蛋白酶切割敏感。

12.权利要求11的方法，其中在还原剂存在的情况下暴露于所述蛋白酶。

13.权利要求12的方法，其中所选的肽配体包含两个或更多个独立的多肽，每个所述多肽均在至少一个位置上与分子支架连接。

14.权利要求11-13中任一项的方法，其中所述一种或多种肽配体为肽配体库。

15.一种肽配体库，每个配体包含两个或更多个独立的多肽，每个所述多肽均在至少一个位置上与分子支架连接。

16.权利要求15的库，其中所述肽配体能够特异性地结合一个或多个靶标。

17.权利要求16的库，其中所述肽配体是多特异性的。

18.权利要求15-17中任一项的库，其在噬菌体上展示。

19.权利要求1-6中任一项的方法，其中所述肽配体对于靶标的结合特异性通过对一个或多个肽环的蛋白酶切割来改变。

20.权利要求1-6中任一项的方法，其中与所述靶标结合的肽配体还通过如下修饰：

(a)氨基酸侧链修饰或取代；或

(b)多肽骨架修饰。

21.权利要求19的方法，其中所述骨架修饰选自：在蛋白酶切割位点附近引入D-氨基酸、还原肽键和N-甲基化。